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二二八事件紀念基金會
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二二八事件紀念基金會，是中華民國行政院依《二二八事件處理及賠償條例》於1995年10月設立的公設財團法人機構，創立初期工作重點在於賠償、紀念活動與撫慰，2009年經營二二八國家紀念館。

建立

1990年11月29日，中華民國行政院成立「行政院研究二二八事件專案小組」，研議有關善後處理問題，先後公布研究報告及成立二二八建碑委員會，並指定內政部辦理申報核備此一事件受難者之人數。小組召集人邱創煥表示，建議進一步蒐集資料，並公布真相、成立專館、專室或紀念館，以及查尋失蹤人口。

1991年3月4日下午，總統李登輝約見二二八事件遺族李月美、郭勝華、張玉蟬、陳重光、林宗義、黃阮美娃及陳盤谷等七位代表。此會是由翁修恭牧師及《曠野》雜誌發行人蘇南洲的安排下，家屬並請求豎立紀念碑、成立二二八紀念基金會、向臺灣人民、遺族、國際交代五事項。次年，2月26日，中國國民黨立法院黨政協調工作會在中央黨部招開早餐會報，通過立委葛雨琴建議，先成立「中國國民黨立院黨團二二八委員會」，望透過與家屬的聯繫、協調，協助平撫創痕，能以民意機關立場，有效監督政府妥善處理各項後續問題。

1993年3月24日，行政院研究二二八事件專案小組，建議內政部應儘速與法務部等有關機關會商，擬具相關草案，建議基金會置董事二十一人，董事由政府代表、專家學者、社會公正人士、受難者或受難者家屬代表共同組成之。6月10日上午，行政院院會通過《二二八事件處理及賠償條例》草案，將捐助新台幣二十億成立二二八事件基金會。6月16日，法務部長馬英九、內政部長吳伯雄對二二八遺族屬表示歉意，其中馬英九表示對整個事件政府難辭其咎，望藉由法案來表達政府的善意與誠意。

1994年3月9日，林洋港以國民黨副主席身分在國民黨中常會提出臨時動議，加速二二八遺族賠償事宜。國民黨內政委員會召集委員徐中雄和陳宏昌，表示當年國民黨的失職，如今不應由全體納稅人來負擔，這不符合社會公義，應以國民黨黨產賠償，獲得新黨立委陳癸淼、民進黨立委沈富雄等在野黨贊同。

1995年3月23日，立法院院會經過二十三次表決及重付表決，國民黨團強力動員通過補償條例，原處理補償事宜的「二二八事件賠償委員會」，易名為「財團法人二二八事件紀念基金會」，民進黨團尊重表決結果。為負責辦理補償金發放及舉行紀念活動，7月24日內政部社會司主其事，先動支行政院第二預備金四千萬元作為二二八紀念基金會創立基金。行政院秘書長趙守博於10月6日表示，行政院已核定二二八紀念基金會的運作等相關規定，內政部社會起先暫代基金會收件。7日，行政院核定二二八事件紀念基金會董、監事名單：董事有內政部長黃昆輝、教育部長郭為藩、法務部長馬英九、行政院政務委員張京育、中研院社科所研究員賴澤涵、中研院近代史研究員張玉法、國民黨黨史委員會代主任委員李雲漢、律師張天欽、中國軍人之友社理事長陳重光、牧師翁修恭、世界新聞傳播學院董事長葉明勳、旅加教授林宗義、中華二二八和平促進會秘書長張秋梧、台南縣二二八公義和平救世會理事長沈義人、台北市二二八關懷協會常務理事楊光漢；監事有財政部長林振國、行政院主計長汪錕、監察院審計長蘇振平。

運作

李登輝政府時期

1995年10月21日，二二八事件紀念基金會召開首次董事會，推選行政院政務委員張京育為董事長，基金會隨即運作。對於基金會是否可長期存在，法律見解不一，因條例第三條規定「行政院為處理二二八受難者之認定及申請補償事宜，得設立二二八事件紀念基金會」，顯然基金會成立是為辦理補償而存在，但條例第11條規定，基金會之基金用途包括「舉辦二二八紀念活動、舉辦協助國人瞭解二二八真相之文宣活動、二二八事件教材或著作之補助、有關調查、考證活動之補助，及有助平反受難者名譽及促進台灣社會和平之用途」，法條上也沒定明顯的基金會結束期限。

1996年1月29日，基金會討論依法補償二二八受難者的補償金基數問題，達成死亡獲六十個基數，多重傷害最高五十八個基數、重傷者三十至五十個基數、非重傷但情況特殊者二十個基數以下、輕傷十個基數以下，羈押或徒刑未滿六個月者六個基數、六個月以上未滿一年者十個基數、一年以上未滿兩年者十七個基數，以此累積每逾一年增加五個基數，但最多不超過五十個基數，財務、名譽及健康受損者，在二十個基數以下。

次月27日，基金會審查通過首批四位受難者家屬補償申請案，每人可獲六百萬元最高額補償金。馬英九回憶他在行政院擔任研考會主委時，就參與行政院二二八事件處理小組工作，在二二八基金會成立後，因擔任部長的關係擔任董事，實際參與了補償事件的審查，由於這樣的經驗，讓認識了許多遺族，開始了解家屬的痛苦與陰影。

之發生部分受難者家屬要求清楚交代其先人受難事實，有的甚至還拒領補償金，於是基金會於1997年3月31日成立二二八事件真相調查小組，成員包括廖正豪和內政部長林豐正、教育部長吳京、基金會董事林宗義等人，將結合台大教授鄭欽仁等學者作實地調查。除了對受難者家屬金錢補償外，二二八基金會已也採取刊登政府公報、刊登報紙和赴受難者家中精神撫慰等方式，恢復二二八受難者的名譽。如1997年7月10日，執行長鄭興弟率隊飛抵到花蓮張七郎故宅、並至其三人墳前弔念，另一方面也約談案發當時的十多名見證人，做為申請補償金的佐證。基金會並對二二八的相關研究予以著作補助，開辦獎學金鼓勵碩士班和博士班研究生進行二二八論文研究。

陳水扁政府時期

2003年8月27日，執行長李旺臺提議，董事會通過會務人員減薪案，減薪幅度為五％至一四．○五％，自9月1日生效，並將會務人員部分，原訂專任十五至廿人，修訂為十至十五人。

2006年2月18日，基金會發表以《蔣中正總統檔案》「大溪檔案」作史料的《二二八事件責任歸屬研究報告》，編作者之一中研院近史所副研究員陳儀深強調，可證明蔣介石不但派兵，還包庇陳儀、彭孟緝、柯遠芬等明顯應負責任者。引起國民黨立委蔣孝嚴在同月23日對台北地檢署控告基金會董事長陳錦煌、中央研究院副研究員陳儀深、國史館館長張炎憲誹謗，求償五十億元。

由於遺族希望基金會能永續經營，讓基金會以檔案資料典藏、研究報告、推廣教育文化活動以及國際交流四大層面為主要功能，行政院長蘇貞昌2007年作出裁示，由內政部主管，改隸為由教育部主管。

2008年1月31日，林暐哲母親、二二八事件遺族的張秋梧到基金會抗議，表示民進黨政府上台後運作卻變樣，排除異己、補助款發放不公、拒用民間推薦董事，要求董事長陳錦煌、執行長楊振隆下台負責，彰化縣二二八關懷協會執行長張淑芬則與張秋梧發生扭打，引起王世堅為阿姨張秋梧叫屈。

馬英九政府時期

2009年2月22日，總統馬英九裁示，未來每年編足基金會三億元預算，編足十五億元基金後，所生孳息將用作基金會運作，去年度遭凍結的部分，行政院將向立法院申請解凍並保留，今年度遭刪除預算，將在未來年度繼續補足，指示各部會全力協助基金會運作。同月24日，馬英九出席福臨春元團拜茶會，對於部分藍委主張二二八基金會的賠償任務已完成，不應再編列預算，馬英九引用條例規定指出，基金會設立目的也包括使國民瞭解事件真相、撫平歷史傷痛、促進族群融和任務，因此基金會仍必要繼續運作。

5月25日，他出訪前，在府院黨高層會議中親自交代行政、立法體系，要求七大法案務必在本會期通過，其中就包括二二八基金會的修法條例。6月5日，《二二八事件處理及賠償條例》修正案通過，讓二二八事件紀念基金會永續經營，預定設立二二八國家紀念館，委託此基金會經營管理，另外基金會遺族代表組成，由原本條文中不得少於紀念基金會委員總額四分之一，修正為不得少於三分之一。

蔡英文政府時期

政黨輪替後，董事長陳士魁請辭。2016年9月30日董事會選出國立政治大學台灣史研究所教授薛化元出任董事長，執行長則由遺族楊振隆回鍋接任。