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甲型流感病毒H3N2亚型是一种可以引起流行性感冒（流感）的病毒亚型。H3N2可以感染鸟类以及哺乳动物，在鸟类、人类和猪身上的该病毒已经变异出许多毒株。在最近的几年，该病毒亚型已经成为导致入院者增多的主要原因。

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H3N2是甲型流感病毒的一种病毒亚型，并且是造成人类流感疫情的重要原因。该病毒的命名来源于其表面两种蛋白质的形式。其中的一种称为血凝素（HA），另一种称为神经氨酸酶（NA），H3N2可以通过遗传重组亚型交换内部蛋白质的基因。

季节性H3N2流感

季节性流感每年在美国可导致约三万六千人的死亡。通过对H1N1、H3N2、H1N2以及B型流感突变体在下一季的扩散可研制出流感疫苗。南半球和北半球会为它们当地的年度流行单独准备研制疫苗，而在热带地区的流感则一般没有明确的季节性。在过去的十年中相较H1N1、H1N2和B型流感，H3N2在流感患病原因中一直占据主导地位。H3N2对标准抗病毒药物金刚烷胺和金刚乙胺的抗药性则逐渐从1994年的1%上涨到2003年的12%，再到2005年的91%。

季节性H3N2流感是一种由H3N2亚型病毒导致的人类流感，该季节性流感从东亚以及东南亚的混合流行病中流出并导致全球性的感染，并在最后被遏制。对病毒来源地确定可以使全球的卫生官员更准确的预测哪些病毒最有可能未来的一年导致大范围的感染。世界卫生组织的全球流感监测网络对2002年至2007年在六个大洲采集的一万三千个甲型H3N2流感病毒样本进行了分析，结果显示东亚和东南亚国家新出现的H3N2的时间一般比其他地区早6到9个月。根据该团队的报导，病毒株会传播到澳大利亚和新西兰，其次是北美和欧洲，而在又一个6到9月之后才会到达南美洲。

猪流感

2007年的一项报导指出：“在猪身上的三种甲型流感病毒（H1N1、H3N2和H1N2）正在世界范围内传播。在美国，典型的H1N1亚型在猪群中十分流行，而自1998年8月下旬以来H3N2开始从猪身上分离出来。大多数H3N2病毒分离物都是三重分离物，其一般含有来自人类（HA、NA和PB1）、猪群（NS、NP和M）以及鸟类（PB2和PA）谱系的基因。在美国，目前针对养猪场中猪流感病毒（SIV）控制和预防的当前疫苗接种政策通常包括使用可以在市场购得的几种二价SIV疫苗之一。在近期检查的97种H3N2分离物中只有41种与三种市售SIV疫苗的抗血清交叉反应强烈。由于流感疫苗的保护能力主要取决于疫苗病毒与流行病毒之间的匹配程度，因此，非反应性H3N2 SIV变异的出现表明了目前的市售疫苗可能无法有效保护猪群不受大多数H3N2病毒的感染。”

H3N2禽流感病毒在中国猪群中流行并在越南的猪身上被检测出来，这对新变异株的产生器到了促进作用。这种病毒可以与H5N1病毒组合（即通过基因重配交换同源基因组亚单位），传递基因并变异为一种在人类之间容易传播的形式。H3N2是由H2N2抗原转移而来，并且在1968年和1969年造成了香港流感的大爆发并导致了多达75万人的死亡。H3N2是造成2006年1月人类年度流感的主要毒株。至2015年，人体中H3N2中标准抗病毒药物金刚烷胺和金刚乙胺的抗药性已经增加到了91%。2004年8月，中国研究人员在猪身上发现了H5N1病毒。

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