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南京大學圖書館是首批全國古籍重點保護單位，歷史源遠流長，其發展可上溯至二十世紀初建立的中央大學圖書館和金陵大學圖書館。在南京大學圖書館的歷史上，著名圖書館學家劉國鈞、 李小緣、施廷鏞和國學大師胡小石等諸先生，先後主持過館務。

南京大學圖書是國內較早從事計算機應用的高校圖書館。1986年在國內首先研製成功條型碼計算機中文圖書流通管理系統並投入實用。1992年開發的中文採購、編目管理系統等正式投入實際使用，受到同行的廣泛好評。1998年底，南京大學圖書館全面更新了圖書館管理系統，各個院系分館正延伸服務，逐步實現南京大學（包括浦口分館）圖書流通的「一卡通」，已有化學化工學院、建築研究所、國際商學院、物理系等院系資料室，均納入圖書館的計算機系統統一管理。

館藏資源

南京大學鼓樓校區圖書館館藏豐富，經長期積累，形成了比較系統、完整的綜合性的藏書體系。至 2007 年底，總藏書量達到 491.70 萬冊（含院系資料室）。館藏古籍線裝書近40萬冊，其中善本古籍有3000餘種、3萬餘冊。地方文獻、古代目錄學文獻以及叢書的收藏已形成特色。古代地方志共收藏有 4000 余種，近4萬冊，在各大圖書館中處於領先地位。收藏了多個國家和地區的多個語種的期刊，尤以物理、生物、地學、數學為特色。1949年以前的中文社會科學書刊與自然科學收藏也比較豐富。 鼓樓校區圖書館加大了發展電子文獻的力度，購買了多種網絡數據庫、光盤數據庫。至2007年底，可提供利用的電子全文包括：中文期刊 16529 種、外文期刊17272種、中文圖書54萬種、外文圖書26.50萬種，外國碩、博士學位論文10萬餘篇。

南京大學仙林國際化校區圖書館，地處校區心臟地帶，位於校園禮儀大道北端，正對校區主入口，依山傍水，是仙林國際化校區的標誌性工程，與周圍的公共教學樓、基礎實驗 樓、國際學院、行政樓、綜合體育館、大學生活動中心等共同構成校園核心景觀區。 南京大學仙林國際化校區圖書館占地近13000平方米，總建築面積 51223.8 平方米。外部造型獨特，風格莊重典雅，局部又跳動着引人注目的「音符」；建築共分五層，以閱覽空間和書庫為主，同時配套設置目錄廳、出納廳等設備和辦公輔助用房，整體布局緊湊合理；採用人性化設計的館內水平和垂直通道將各類用房有機結合在一起，通過科學安排編 、藏、閱之間的運行路線，使讀者、工作人員、書刊運輸路線便捷通暢、互不干擾，形成高效的整體，既為學校未來發展預留了一定的發展空間，又凸顯國際化校區圖書館多功能 、現代化、休閒化和個性化服務的人文理念。設計館藏300萬冊，建成後不僅將成為南大師生學習、研究的文獻中心，也可為在寧高校、江蘇乃至全國提供文獻信息服務，對於提高整個高校教學和科學研究的信息保障能力、加速高等教育信息化進程和南京大學國際化進程都具有十分積極的意義。

坐落於浦口校區，2007 年5月落成使用，它是由香港陳曾燾先生暨思源基金捐資人民幣 2000 萬元助建的，總建築面積 30510 平方米 ，地下一層，地上五層。圖書館所使用面積為 10000 平方米 。思源圖書館是南京大學圖書館設在浦口校區的文獻信息服務中心，現設圖書借閱室、書刊閱覽室、多媒體閱覽室和影視鑑賞室等，共收藏中外文書刊 30 多萬冊，DVD、VCD、CD-ROM等 2000 多件，為讀者提供書刊借閱、文獻複製、網上查詢、影視鑑賞、通借通還、讀者培訓等基礎服務。浦口校區思源圖書館收藏了 80 多個國家和地區 20 多個語種的期刊。浦口校區思源圖書館在教育主管部門的支持下，全國高校的地科(地質、地理、氣象、天文、環境科學)教材中心、文科文獻中心相繼建成，進一步增加了館藏內容和特色。

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