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微生物学是研究微生物的一门学科。微生物包括病毒、原核生物和简单的真核生物。目前，微生物学的最主要工作是用生物化学和遗传学方法完成的。由于很多病原（像是造成植物病害的四大病原：病毒、真菌、线虫、细菌）都可以算是广义的微生物，微生物学也和病理学、免疫学和流行病学密切相关。微生物学家对生物学和医学做出过基础性贡献，尤其在生物化学、遗传学和细胞生物学领域。

历史

发展之前

在微生物学发展之前，微生物约在许多世纪前就己被人类所察觉。古罗马学者马库斯·瓦罗在他论述农业的书中提到的第一原则，他警告说不应在沼泽附近建立牧场或宅第，因为在空气中存在肉眼看不到的漂浮物，一旦经由口或鼻进入体内将会产生疾病。

公元1546年，吉罗拉莫·弗拉卡斯托罗提出，传染病是由可借由直接、间接接触或传播媒介传播的种子体（seedlike entities）所引起。

微生物学的诞生

微生物学的发展，随着显微镜的发明而开启，1665年英国人罗伯特·胡克发明显微镜，并观察到细胞轮廓（真菌细胞壁，但当时被认为是简单植物，直到二十世纪中才被证实是真菌），1673年荷兰人雷文霍克使用自己改进的显微镜观察到真正的细胞，随着纪录多种微生物的形态。

• 1798 - 英国人爱德华·詹纳用牛痘接种疫苗，用于预防天花。

• 1864 - 法国人巴斯德发明巴斯德消毒法。

• 1867 - 英国人约瑟夫·李斯特是给病人伤口使用苯酚作为消毒剂的第一个人，发明在手术时避免感染的方法。

• 1876 - 德国人费迪南德·科恩发现内生孢子。

• 1884 - 丹麦人汉斯·克里斯蒂安·革兰发明革兰氏染色。

• 19世纪末 - 德国人罗伯·柯霍提出柯霍氏法则、纯化培养、发现炭疽杆菌（bacillus athracis）及结核杆菌（tubecle bacillus）。

• 1925 - 英国人亚历山大·弗莱明教授发现抗生素盘尼西林。

• 20世纪的40年代后，微生物学的研究成果，被应用于医学、工业、农业等方面。生物研究方面，分子生物学、生物化学、细胞学、遗传学等学科，也常利用微生物作为研究的材料。

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