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胡晋川
工作经历
青年研究员 复旦大学,生物医学研究院/上海市第五人民医院,(2018.1-今) 研究助理 美国北卡罗莱纳大学教堂山分校,(2017.6-2017.12) 博士后 美国北卡罗莱纳大学教堂山分校,(2012.6-2017.5)
教育经历
博士中国科学院微生物研究所,(2004-2012) 学士北京大学,生命科学学院,(2000-2004)
研究方向
课题组致力于开发和利用新的高通量测序技术来检测和研究各种DNA碱基损伤与修复,包括紫外线和顺铂等造成的DNA加合物损伤、8-oxo-dG和AP位点等DNA氧化损伤,以及对应的核苷酸切除修复与碱基切除修复途径。课题组长胡晋川在2015年诺贝尔化学奖得主Aziz Sancar教授实验室做博士后期间,主导开发了Damage-seq和XR (eXcision Repair) -seq方法,分别能以单碱基分辨率检测人类基因组上各种DNA加合物损伤和核苷酸切除修复的发生位置。目前,课题组的研究方向主要包括:1)核苷酸切除修复的分子机制,尤其是转录偶联核苷酸切除修复的分子机制;2)染色质环境中氧化损伤形成与修复的规律,及其参与转录调控的机制;在此基础上,还将研究损伤与修复在相关疾病发生发展中的作用。
代表论文
1.Yongchang Zhu#, Yuanqing Tan#, Lin Li#, Yuening Xiang, Yanchao Huang, Xiping Zhang, Jiayong Yin, Jie Li, Fei Lan, Maoxiang Qian*, Jinchuan Hu*. Genome-wide mapping of protein–DNA damage interaction by PADD-seq. Nucleic Acids Research, 2023, 51(6): e32.
2.Yanchao Huang#, Cem Azgar#, Mengdie Yin, Yi-Ying Chiou, Laura A. Lindsey-Boltz, Aziz Sancar, Jinchuan Hu*, Ogun Adebali*. Effects of replication domains on genome-wide UV-induced DNA damage and repair. PLoS Genetics, 2022, 18(9): e1010426.
3.Jiao An#, Mengdie Yin#, Jinchuan Hu*. G-quadruplex and 8-oxo-7,8-dihydroguanine across the genome: methodologies and crosstalk. Genome Instability & Disease, 2022, 3: 241–254.