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学校拥有一支结构合理、素质优良、充满活力的师资队伍，现有硕士生导师414名、博士生导师184名，其中，中国科学院院士2名，中国工程院院士2名，国务院学位委员会学科评议组成员4名。国家重点学科26个，全军“2110工程”重点学科3个，总后“530工程”重点学科2个，国家临床药理基地2个，上海市重点学科7个，上海市临床医学中心4个，博士后流动站6个。已建立法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学7个学位门类的研究生培养体系，博士学位授权一级学科6个，博士学位授权二、三级学科61个；硕士学位授权二、三级学科78个，硕士专业学位授权点3个（MPH、临床医学、口腔医学），博士专业学位授权点1个（临床医学）。拥有全军医学研究所、医学专科中心、重点实验室30个，其中免疫与基因治疗实验室、生物信号转导实验室和药物化学实验室被评为全军“重中之重”重点建设实验室，研究生专用教学实验室4个，多媒体网络教室26个，野战卫生勤务人员培训基地1个，在全军建立研究生联合培养点13个。