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1938年，纳粹德国吞并奥地利，中华民国与奥地利再度断交。[[第二次世界大战]]后，中华民国和奥地利曾短暂互设公使馆。1949年中华人民共和国建国后，奥地利驻中华民国公使馆闭馆。翌年，中华民国驻奥地利公使馆亦闭馆。但中华民国与奥地利之外交关系在此时并没有中断，直至1971年5月28日中华人民共和国和奥地利建交 <ref>[http://www.china.com.cn/aboutchina/zhuanti/zg365/2009-05/28/content_17836946.htm 1971年5月28日 我国与奥地利建交]，中国网， 2009-05-28</ref> 为止。

自中华人民共和国和奥地利建交以来，两国关系呈现良好发展势头，各领域合作发展加快。1985年9月，时任奥地利总统鲁道夫·基希施莱格成为首位访华的奥地利国家元首。在1993年4月，时任奥地利总理弗朗茨·弗拉尼茨基成为首位访华的奥地利政府首脑。中国方面，1994年6月，时任中华人民共和国[[国务院总理]]的[[李鹏]]访问奥地利，成为首位访奥的中国政府首脑。1999年3月，时任[[中华人民共和国主席]]的[[江泽民]]对奥地利进行国事访问 <ref>[http://jingji.cntv.cn/lm/808/-1/59804.html 1999年3月江泽民对奥地利进行国事访问]，中国网络电视台</ref> ，成为首位访问奥地利的中国国家元首。