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迄至清末，此制历代沿袭，但职权则不尽相同。宋、辽、金、元等朝因为军队组成特殊，不设兵部，以各地枢密院取代，直接听命于皇帝。明代兵部尚书 <ref>[https://www.sohu.com/a/237529701_450711 明朝的兵部尚书究竟是什么级别？根本不是一品官！]，搜狐，2018-06-28 </ref> 号为“本兵”，权位极重，举凡武卫官军选拔、受衔、任命、后勤军需，均为其掌。清代实行八旗制度，兵权归属各旗，兵部只管武职选授、处分及兵籍、军械、纪律、驿站等事，不涉兵权。

兵部下设四个司，总部（明代起改称武选）、职方 <ref>[http://www.doc88.com/p-6939939387996.html 明代兵部职方司职能考论]，道客巴巴，2019-09-15</ref> 、驾部、库部。总部司设主事四人，下辖令史、传书史、制书令史、亭长、掌固等职（人数依朝代各有不同），主管武职官员的考核、职务升降、承袭等事务，并管理土司；职方司设主事两人，下辖令史、书令史、掌固等职（人数依朝代各有不同），主管兵将的叙功、惩处、抚恤、检阅等，清代起兼掌边禁（即现代的海关）；驾部司设主事两人，下辖令史、书令史、掌固等职（人数依朝代各有不同），主管军用马车、战马、后勤运输以及维持驿站等事务；库部司设主事两人，下辖令史、书令史、掌固等职（人数依朝代各有不同），主管军需武器、甲胄、羽箭等的生产、保存、调配，并负责武举相关的事务。