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2004年，原省林业局、海师大等单位合作，通过DNA测序和分子遗传标记等科学手段，发现海南孔雀雉和灰孔雀雉的遗传距离为3.1%，超过了鸟类种与种水平间的遗传距离的范围，应为独立的物种。
这一研究成果于2008年被发表在国际[[动物学]]权威杂志《ZoologicalScience》( （ 《[[动物科学]]》) ） 上，得到国际公认。该论文提出，经过长期独立进化，海南孔雀雉和灰孔雀雉的遗传距离在过去数百万年间差距越来越大，约于440～600万年前分化出来，成为一个独立的种类<ref>[http://www.hi.chinanews.com.cn/hnnew/2013-03-18/292558_2.html 山鹧鸪、孔雀雉、柳莺: 独属海南的特有鸟种(2)]，中国新闻网，2013-3-18</ref>。
==形体特征==