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''' 中国科学院南京地理与湖泊研究所 ''' ，坐落于古都 [[ 南京 ]] 玄武湖畔，前身系1940年8月在 [[ 重庆 ]] 北碚成立的中国地理研究所。1988年1月，改名为中国科学院南京地理与湖泊研究所并沿用至今，是全国唯一以 [[ 湖泊]]-流域系统为主要研究对象的中国地理研究所。

研究所科技创新发展总体布局为长期聚焦“湖泊关键过程与多要素相互作用机理”和“湖泊-流域系统演变及对人类活动的响应与综合管理”两大基础科学问题研究；重点发展“物理湖泊与水文、湖泊生物与生态、湖泊沉积与环境演变、湖泊 [[ 环境 ]] 与工程、流域 [[ 水文 ]] 与资源环境、区域经济地理、遥感与 [[ 地理信息科学 ]] ”七个学科方向；支撑“湖泊水环境治理与生态修复”和“区域可持续发展规划与评估”两大战略研究领域。

截至2014年底，研究所设有一个 [[ 国家重点实验室 ]] ，一个中科院重点实验室；共有在职职工243人，包括研究员及正高级工程 [[ 技术 ]] 人员43人、副研究员及高级工程技术人员73人；共有在学研究生182人（其中硕士生73人、 [[ 博士 ]] 生109人）、在站 [[ 博士 后16 后]]16 人。

第一批全国中小学生研学实践 [[ 教育 ]] 基地。

1937年， [[ 国民党 ]] 国立中央研究院开始筹建地理研究所，并聘请 [[ 李四光 ]] 先生为国立中央研究院地理研究所筹备处主任，后因战乱及经费问题未果。

1940年8月，由中英庚款董事会会长朱家骅提议创建中国地理所，所址设在 [[ 四川 ]] 重庆北碚，黄国璋任所长，所内设：自然地理组、人生地理组、大地测量组、海学组，全所职工40余人。

1947年，中国地理研究所改隶属国民党教育部，所长由林超接任，同时研究所由四川重庆北碚迁至 [[ 南京 ]] 。

1949年，南京 [[ 解放 ]] 由南京市军管会文教部接管，当时所内职工仅剩9人。

1950年，移交中国科学院并成立中国科学院地理研究所筹备处，由 [[ 竺可桢 ]] 、黄秉维任筹备处正副主任。

1953年，中国科学院地理研究所正式成立，由 [[ 黄秉维 ]] 任所长。所内设地理组、大地测量组、地图组。

1957年，大地测量组独立成立测量制图研究室，1958年迁往 [[ 武汉 ]] 组建中国科学院武汉测量制图研究所。

1958年， [[ 国务院 ]] 决定地理所迁往 [[ 北京 ]] ，南京留下部分同志组建南京地理研究所，当时留下的同志主要搞湖泊学，因此成立了湖泊研究室和地理室，由施成熙教授兼湖泊室主任，由任美锷任所长， [[ 周立三 ]] 任副所长。

1970年7月，中科院研究所体制调整时将该所下放 [[ 江苏省 ]] 、归原省科技局领导，改名为“江苏省地理研究所”。

1979年6月，经科学院研究拟同意中科院与省双重领导，以 [[ 中 国 科 学 院 |中科院]] 为主更名为“中国科学院南京地理研究所”。