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1908年至1910年，施在[[吉林]]任职，任内老练妥善地处理了伊藤博文遇刺案 <ref>[http://www.shengzenews.cn/Details/109628.html 施肇基与伊藤博文被刺案]，盛泽丝绸文化旅游网，2013-9-24</ref> 。1909年10月，为解决日俄两国战后争端以及共同瓜分中国[[东北]]利益，前任日本首相、韩国统监伊藤博文乘火车前往中国东北与俄国财政总长科科夫佐夫谈判。26日上午抵达[[哈尔滨站]]时，被朝鲜民族主义者安重根枪击身亡。事发后施肇基立即要求电报局停发所有电报，全面控制消息。同时急电[[北京]]外务部，建议在案情调查清楚之前绝不发表任何声明，“若有人问及此事，[[政府]]千万不可有‘保护不周’之道歉语句，贻日人以口实。”施并积极跟进日俄审讯，录获安重根供词之后，亲自以英文草拟新闻通稿交由北京英文媒体刊发。待到各报陆续刊登之后，施肇基方才恢复电报局正常发报，从而占据了话语权的先机，令日本人“对我报道无法辩驳，故日方对此案迄无抗议”，为[[国家]]化解了一场可能的外交危机。

1912年3月，施肇基博士入唐绍仪内阁，任交通及财政总长，不久因病辞职。1914年至1920年任驻[[英国]]公使，其中并与外交总长[[陆徵祥]]、[[顾维钧]]（驻美）、王正廷（广州政府代表）、魏宸组（驻比）等人及秘书朱佛定组成中国代表团出席1919年巴黎和会。会后，中国代表团拒绝在出卖[[山东]]的和约上签字 <ref>[https://new.qq.com/rain/a/20200404A0DACG00 1919年中国代表团在巴黎和会上为何拒绝签字？大国形象很重要]，腾讯网，2020-04-04 </ref> 。