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胡璐璐
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工作經歷
研究員，復旦大學，生物醫學研究院（2020.11-至今） 博士後 芝加哥大學（2015.2-2020.9）
教育經歷
博士，復旦大學，生物醫學研究院（2009.9-2014.6） 學士，蘇州大學，生命科學學院（2005.9-2009.6） 所獲人才項目
所獲獎項
Excellent Ph. D of Fudan University and Shanghai City，2014 Graduate Star of Scientific Research of Fudan University，2014 Chicago Fellow Award，2015-2017 The Chicago Biomedical Consortium (CBC) fellowship，2016-2017 Leukemia & Lymphoma Society Special Fellow，2017-2020
研究方向
1.課題組成功研發了超微量，低成本單鹼基分辨率的表觀基因組和轉錄組檢測技術，該技術不依賴於高通量測序，僅需1 ng 血液中抽提的cfDNA就可以低成本（低至300元）檢測DNA甲基化和RNA m6A修飾進行單鹼基分辨率的定量分析，無需複雜的數據處理，使用簡單方便，用戶友好，在臨床方向有很好的應用前景。 2.課題組基於「split-pool」策略成功開發了單細胞尺度的DNA 5hmC測序技術，可以基於DNA 5hmC修飾對神經細胞進行精細分群，為研究腦科學和腦疾病中的單細胞DNA 5hmC特徵提供了實用的工具。 3.研發檢測RNA亞細胞定位的新技術。目前研究RNA亞細胞定位的技術APEX-Seq需要過表達質粒或者慢病毒感染，對細胞狀態影響較大。課題組開發無需過表達質粒或者慢病毒感染的原位擴增技術，來檢測無膜細胞器例如P-body, nuclear speckle, stress granule 和autophagosome中的RNA含量和豐度。 4.以往的認知中，細胞膜外表面分布着蛋白質，脂類以及糖鏈修飾，然而最新的研究表明，細胞膜外表面存在被糖基化修飾的RNA。有一些膜蛋白，例如P62細胞自噬受體受到小RNA的調控。課題組研發細胞膜外表面RNA的擴增和檢測技術，並且專注於研究細胞膜外表面RNA的結合蛋白和詳細功能，探索受到RNA調控的膜蛋白種類和具體機制。
代表論文
1、m6A RNA modifications are measured at single-base resolution across the mammalian transcriptomeLulu Hu*#, Shun Liu*, Yong Peng*, Ruiqi Ge,* Rui Su*, Chamara Senevirathne, Bryan T. Harada, Qing Dai, Jiang bo Wei, Lisheng Zhang, Ziyang Hao, Liangzhi Luo, Huanyu Wang, Yuru Wang, Minkui Luo, Jianjun Chen#, Mengjie Chen# & Chuan He# Nat Biotechnol. 2022 Mar 14. doi: 10.1038/s41587-022-01243-z. (* represents equal contribution and # represents corresponding)
2、Hu L*, Liu Y*, Han S*, Yang L*, Cui X, Gao Y, Dai Q, Lu X, Kou X, Zhao Y, Sheng W, Gao S, He X, He C. Jump-seq: Genome-Wide Capture and Amplification of 5-Hydroxymethylcytosine Sites. J Am Chem Soc. 2019 Jun 5;141(22):8694-8697. doi: 10.1021/jacs.9b02512. Epub 2019 May 23.