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倪挺
工作經歷
2000年獲北京大學生命科學學院生物化學及分子生物學系學士學位,2000-2006年碩博連讀於北京大學生命科學學院並於2007年獲植物學博士學位。2007-2010年在美國杜克大學基因組科學與政策研究所從事博士後研究。2010-2012年在美國國立衛生研究院(NIH)擔任助理研究員(Research Fellow)。2012年受聘為復旦大學生命科學學院。
研究方向
針對中心法則中轉錄的三個核心環節(轉錄起始、延伸和終止)發展了三個高通量測序新方法,建立了轉錄組從頭到尾的研究體系,豐富了對於基因轉錄這一基礎分子生物學問題的認識。目前以細胞衰老和腫瘤細胞增殖為研究體系,結合高通量測序、分子生物學和生物信息學等手段研究複雜的轉錄組調控,特別是內含子保留和選擇性多聚腺苷酸化等RNA水平調控方式的生物學功能和分子機制。在Nature、Science、Nature Methods、NAR等雜誌發表近40篇SCI研究論文,成果被Nature Methods、Nature Reviews Genetics等評述。申請中美專利15項(7項獲授權)。長遠目標:通過研究真核生物轉錄組的多樣性,了解高等生物複雜的基因調控網絡,為深入理解人類疾病的表達機制提供理論依據。
代表論文
1.Ni T#, Corcoran DL#, Rach EA, Song S, Spana EP, Gao Y, Ohler U* and Zhu J*. A paired-end sequencing strategy to map the complex landscape of transcription initiation.Nature Methods (Article), 2010; 7: 521-527
2.Ni T#*, Yang W#, Han M#, Zhang Y, Shen T, Nie H, Zhou Z, Dai Y, Yang Y, Liu P, Cui K, Zeng Z, Tian Y, Zhou B, Wei G, Zhao K, Peng W*, Zhu J*. Global intron retention mediated gene regulation during CD4+ T cell activation.Nucleic Acids Research. 2016; 44(14):6817-29
3.Ni T#*, Yang Y#, Hafez D, Yang W, Kiesewetter K, Wakabayashi Y, Ohler U, Peng W and Zhu J*. Distinct polyadenylation landscapes of diverse human tissues revealed by a modified PA-seq strategy.BMC Genomics, 2013; 14(1):615
4. Majerciak V#, Ni T#, Yang W, Meng B, Zhu J* and Zheng ZM* A viral genome landscape of RNA polyadenylation from KSHV latent to lytic Infection. PLOS Pathogens, 2013; 9(11):e1003749