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何柏毅

來自 西湖大學 的圖片

本名 何柏毅 國家 中國 外語

何柏毅，是中國西湖大學著名的研究員、博士生導師。

簡介

何柏毅，西湖大學工學院助理教授，目前主要研究方向為微生物群的定量工程，廣泛研究方向包括生物物理學、合成生物學、微生物生態與進化學等。

2014年獲美國耶魯大學物理學學士學位，2019年獲美國哈佛大學應用物理學博士學位，2019年至2023年在斯坦福大學從事博士後工作。

學術成果

微生物群落對宿主的健康產生廣泛且重要的影響，其工程是改善宿主健康的重要工具。我們的實驗室通過結合數學模型和高通量實驗將微生物組改造變為量化工程。同時，我們也廣泛關注生命系統的物理學和合成生物學。正在進行的研究項目包括：

- 我們能夠通過單個腸道菌種的代謝組學來預測體外的群落動態（Ho et al, Nat Microbiol 2024）。我們正在運用類似方法來研究複雜環境中和進化過程中的微生物相互作用。

- 抗生素作用可以影響物種間的資源競爭，反之亦然，這種相互作用可以導致多種抗生素之間的協同或抑制作用（Newton, Ho# et al, Nat Commun 2023）。我們正在使用高通量篩選實驗測試這些模型預測，並利用它們來設計群落動態。

- 我們構建了一個兼具高度多樣性和明確性的模式群落，此群落可重複性地定植於小鼠腸道，而且被模式群落或人類糞便群落定植的小鼠在表型上是相似的（Cheng*, Ho* et al, Cell 2022）。我們正在系統性地量化此模式系統中各物種的相互作用。

- 廣泛微生物群的物種豐度表現出特殊的時間波動，這些波動可以通過資源競爭的數學模型來重現（Ho et al, eLife 2022）。我們正在利用這關係來推斷各種微生物群的動態啟動因素。

代表論文

1. Ho P*#, Nguyen TH*, Sanchez JM, DeFelice BC, and Huang KC#. 「Resource competition predicts in vitro assembly of gut bacterial communities.」 Nat Microbiology (in press).

2. Newton DP, Ho P#, Huang KC#. 「Modulation of antibiotic effects on microbial communities by resource competition.」 Nature Communications (2023).

3. Cheng AG*, Ho P*, …, Huang KC, and Fischbach MA. 「Design, construction, and in vivo augmentation of a complex gut bacterial community.」 Cell (2022).

4. Ho P, Good BH, and Huang KC. 「Competition for fluctuating resources reproduces statistics of species abundance over time across wide-ranging microbiotas.」 eLife (2022).

5. Ho P, Martins BMC, and Amir A. 「A mechanistic model for the regulation of cell division timing by the circadian clock in cyanobacteria.」 Biophysical Journal (2020).

6. Ho P, Lin J, and Amir A. 「Modeling cell size regulation: From single-cell level statistics to molecular mechanisms and population level effects.」 Annual Review of Biophysics (2018).