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胡璐璐
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工作经历
研究员，复旦大学，生物医学研究院（2020.11-至今） 博士后 芝加哥大学（2015.2-2020.9）
教育经历
博士，复旦大学，生物医学研究院（2009.9-2014.6） 学士，苏州大学，生命科学学院（2005.9-2009.6） 所获人才项目
所获奖项
Excellent Ph. D of Fudan University and Shanghai City，2014 Graduate Star of Scientific Research of Fudan University，2014 Chicago Fellow Award，2015-2017 The Chicago Biomedical Consortium (CBC) fellowship，2016-2017 Leukemia & Lymphoma Society Special Fellow，2017-2020
研究方向
1.课题组成功研发了超微量，低成本单碱基分辨率的表观基因组和转录组检测技术，该技术不依赖于高通量测序，仅需1 ng 血液中抽提的cfDNA就可以低成本（低至300元）检测DNA甲基化和RNA m6A修饰进行单碱基分辨率的定量分析，无需复杂的数据处理，使用简单方便，用户友好，在临床方向有很好的应用前景。 2.课题组基于“split-pool”策略成功开发了单细胞尺度的DNA 5hmC测序技术，可以基于DNA 5hmC修饰对神经细胞进行精细分群，为研究脑科学和脑疾病中的单细胞DNA 5hmC特征提供了实用的工具。 3.研发检测RNA亚细胞定位的新技术。目前研究RNA亚细胞定位的技术APEX-Seq需要过表达质粒或者慢病毒感染，对细胞状态影响较大。课题组开发无需过表达质粒或者慢病毒感染的原位扩增技术，来检测无膜细胞器例如P-body, nuclear speckle, stress granule 和autophagosome中的RNA含量和丰度。 4.以往的认知中，细胞膜外表面分布着蛋白质，脂类以及糖链修饰，然而最新的研究表明，细胞膜外表面存在被糖基化修饰的RNA。有一些膜蛋白，例如P62细胞自噬受体受到小RNA的调控。课题组研发细胞膜外表面RNA的扩增和检测技术，并且专注于研究细胞膜外表面RNA的结合蛋白和详细功能，探索受到RNA调控的膜蛋白种类和具体机制。
代表论文
1、m6A RNA modifications are measured at single-base resolution across the mammalian transcriptomeLulu Hu*#, Shun Liu*, Yong Peng*, Ruiqi Ge,* Rui Su*, Chamara Senevirathne, Bryan T. Harada, Qing Dai, Jiang bo Wei, Lisheng Zhang, Ziyang Hao, Liangzhi Luo, Huanyu Wang, Yuru Wang, Minkui Luo, Jianjun Chen#, Mengjie Chen# & Chuan He# Nat Biotechnol. 2022 Mar 14. doi: 10.1038/s41587-022-01243-z. (* represents equal contribution and # represents corresponding)
2、Hu L*, Liu Y*, Han S*, Yang L*, Cui X, Gao Y, Dai Q, Lu X, Kou X, Zhao Y, Sheng W, Gao S, He X, He C. Jump-seq: Genome-Wide Capture and Amplification of 5-Hydroxymethylcytosine Sites. J Am Chem Soc. 2019 Jun 5;141(22):8694-8697. doi: 10.1021/jacs.9b02512. Epub 2019 May 23.