鼓楼的朝向和明代中轴线平行，从明代地图上看，鼓楼和钟楼就位于这条中轴线的一侧，其“西北—东南”的朝向正与中轴线一致。明代南京钟楼鼓楼位置的选择也有玄机，它们距离朝阳门（中山门）、仪凤门、聚宝门（中华门）的距离大致相等，可以算是当时城市的中心位置。由此可见，明代南京鼓楼的朝向，其实就是由于南京城墙外形决定的。南京城墙的外形不规则，不是古代城墙常见的方形或者矩形，导致了其中轴线也不可能是南北走向。“西北—东南”的城市中轴线，形成了南京鼓楼看似怪异的布局和朝向，同时也反映了南京这座明代都城在城市规划上的特殊寓意。