大觉寺派为了早日让自己系统的皇嗣继位，便对幕府展开公关攻势。幕府再次施加影响，后伏见天皇在位不到3年，即行让位给太子，为[[后二条天皇]]。
[[File:两统迭立1.jpg|缩略图|左|[https://cul.qq.com/a/20160721/021085.htm 原图链接]两统迭立示意图]]
后来，后伏见上皇弟弟[[花园天皇]]在位时，他又主持过一段时间的院政。<ref>[[松桥达良]]，《元号はやわかり—东亜历代建元考》，砂书房，1994年7月，ISBN 4915818276</ref>