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自體免疫疾病泛指人體內免疫細胞攻擊自己身體正常組織細胞，引起病變的疾病。常見的疾病例如紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎、乾燥症、硬皮症、僵直性脊椎炎等。

免疫系統：身體裡的守衛部隊

免疫系統就像是我們身體裡的軍隊，免疫細胞就好比身體裡的軍人，不同的軍人執行不同的職務，必須分工合作，相互支援才能維持國家的安全。免疫細胞亦是如此：巨噬細胞是先遣部隊，能夠迅速地吞噬外來的入侵者，但比較會誤殺自身細胞，這時候就需要受過訓練的T細胞幫忙；T細胞分為輔助T細胞、抑制T細胞和細胞毒殺T細胞，由於受過胸腺學校訓練，能夠精密地擬定作戰策略，精準調控作戰方向；B細胞會經由T細胞的協助，辨識外來物並製造適合的武器(抗體)攻擊；自然殺手細胞就有點像是化學兵，用帶有破壞性的酶摧毀受感染的細胞或生長異常的細胞，例如癌細胞。不同的免疫細胞各具有不同的功能，如果我們身體裡的軍人敵我不分，不去擊退外來的敵人(病毒、細菌或是癌細胞)，反而攻擊自己，病變就會發生了。<ref>[http://www.an-ho.com.tw/tw/index.asp?au_id=38&sub_id=53 自體免疫疾病]，認識自體免疫疾病-安禾診所</ref>