宋嘉泰四年(公元1204年),蒙古铁木真征服乃蛮,乃蛮西迁,斡亦刺惕部崛起,本地为窝阔台封地,设尚书省、行省。
[[ 明朝 ]] 之际,称斡亦刺惕为瓦刺,即史称四卫拉特。
[[ 康熙 ]] 三十五年(公元1696年)尽服准噶尔部,准噶尔由定边将军治下。
[[ 雍正 ]] 十二年(公元1735年),清廷准左列将军策凌奏议同意喀尔喀与准噶尔部牧地以阿尔泰岭、哈巴、博尔济(县名异译)为界。
清 [[ 乾隆 ]] 二十年(公元1755年), [[ 清朝 ]] 平定准噶尔。
清乾隆二十四年(公元1759年),清平定大小和卓叛乱,统一新疆。
清乾隆二十七年(公元1762年),清设“总统伊犁等处将军”,统辖天山南北路,本地属将军治下塔尔巴哈台参赞大臣管理。
清 [[ 同治 ]] 六年(公元1867年),清设布伦托海办事大臣兼领塔城、阿尔泰事务,1869年撤布伦托海办事大臣,阿尔泰仍归科布多参赞大臣管理。
1906年科布多、阿尔泰分治,吉木乃始属阿尔泰办事大臣治下,直属清理藩院。
1954年经国务院批准为区别蒙古国和苏联的阿尔泰名称,改称阿勒泰专区,吉木乃县一直隶属阿勒泰地区。
==行政区划==