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西藏和平解放后，中国共产党及人民政府重视藏医药的发展。1959年， 门孜康与原药王山门巴扎仓合并，建成拉萨市藏医医院。1980年，该院改为西藏自治区藏医院。在硬件方面，人民政府曾拨款23万元，改建了若干铁皮房，将门诊部移到门孜康旧楼的前面，以方便群众就医。1976年，人民政府进一步拨款121万元，兴建了新的门诊大楼。