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台灣過去曾有兩種原生野生睡蓮的記錄： [[ 子午蓮 ]] （Nymphaea tetragona）及藍睡蓮。不同地區發現的藍睡蓮族群，花色、植株尺寸都存在差異，植物學家難以斷定這些族群是否為同一物種。這樣的情況導致過去文獻使用不同學名標記藍睡蓮，分類群歸屬混亂；最主要使用於藍睡蓮的兩個學名是Nymphaea nouchali和Nymphaea stellata。1989年， [[ 英國 ]][[ 植物學家 ]][[ 瓦德科特 ]] （Bernard Verdcourt）檢視相關標本後，認為過去標記成兩個不同學名的植物其實並無二致，因此採用較早發表的學名Nymphaea nouchali，把Nymphaea stellata視為同物異名。然而，由於過去文獻描述的上述兩者在外部形態的說明並不精確，導致野地某些睡蓮族群皆符合兩者的文獻描述，卻在細微性狀（例如花色、葉片裂片有無重疊）有所差異，因此這樣的分類處理是否合適，仍需深入研究。筆者暫且採納瓦德科特的看法，把兩個學名指涉的植物視為同一物種。

[[ 台灣 ]] 相關文獻中，藍睡蓮最早出現於《[[台灣植物誌]]》第一版，描述為「Nymphaea nouchali，中文俗名『白花睡蓮』，產地嘉義、台南」。隨後出版的第二版描述為「Nymphaea stellata，中文俗名『藍睡蓮』，產地新竹、嘉義」。兩版植物誌均描述其花淡藍色，生長環境為池塘；此外第二版附註說明「可能已在台灣滅絕」。1922年，日本植物學家佐佐木舜一（Shun-ichi Sasaki）在台南大正公園採集到一份藍睡蓮標本，該標本只有一朵花和一片葉子，花朵相當殘缺，難以辨識花色；這份標本現保存在林業試驗所中，無法確認原始來源是野生或是由園藝家引介栽植。在那之後，也沒有可靠的記錄證明藍睡蓮依然存在台灣野地。<ref>[https://sa.ylib.com/MagArticle.aspx?id=4690 失落的水邊精靈－藍睡蓮] 科學人雜誌</ref>