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黄昌贤，1910年9月24日出生于[[广东省]]汕头市。自幼受到良好的教育。1926年7月，进入国立中山大学附设专门部学习园艺学。1931年毕业后升入该校农学院园艺系继续学习。1933年毕业，获农学学士学位。同年，黄昌贤考入岭南大学（当时由美国基督教会主办）就读研究生，1934年，他抱定振兴中华农业的宏愿，矢志园艺，赴美留学，该年秋考入美国俄勒冈州立大学，1936年获园艺学理学硕士学位。之后，又先后到 [[ 美国 ]][[ 洛杉矶 ]][[ 加利福尼亚大学 ]] 、 [[ 佛罗里达大学 ]] 、 [[ 密歇根州 ]] 立大学的研究院继续深造，1940年获园艺系哲学博士学位。

在美国求学的六年中，他充分利用 [[ 美国图书馆 ]] 的丰富资料，废寝忘食，如饥似渴地吮吸园艺科学知识，积累了大量的摘要卡片和论文报告资料。他不满足于书本知识，经常参加美国园艺界的各种学术会议；先后考察了美国佛罗里达州最南部的孔斯特（HomesTead）亚热带果树试验场，柑桔、油梨采收包装厂，俄勒冈州的重要苹果产区活河谷园艺试验站，核桃试验园，西部沙漠地区的枣椰子试验站，东部阿诺植物园等；参观访问了美国许多大学、农业院校和科研机构；拜会了国际柑桔分类权威施文格（W．T．Swingle）博士，世界著名园艺学专家贝利（L．H．Bailey）教授，著名植物生理学家克劳斯（E．J．Kraus）教授等，掌握了美国不同气候区域的园艺生产及园艺科研情况。他还特别注意了解南部亚热带地区果树引种栽培经验及引入外国植物的检疫隔离方法和设备。这对他以后在广东、广西、云南等地致力于引进、培育国内外优良珍稀果树和重视植病检疫起了重要的导向作用。