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根据科学考察，东洞庭湖自然保护区记录到鱼类12目23科114种，其中：国家一级保护的有中华鲟、白鲟2种；二级保护的有鳗鲡、胭脂鱼2种.鸟类13目50科306种，其中：国家互助保护的有白鹤、白头鹤、白鹳、黑鹳、大鸨、中华秋沙鸭，白尾海雕7种：二级保护的有小天鹅、鸳鸯、白枕鹤、灰鹤、小白额雁等37种.国际协约指定保护的有59种.两栖类、腹足类、软体类、瓣鳃类等动物68种，其中：国家一级保护的有白暨豚，三级保护的有江豚.区内有植物115科159属1186种.其中：国家一级保护的有3种；二级保护的有31种。东洞庭湖丰富的自然资源，引起了全世界的普遍关注和重视、被誉为“长江中游的明珠”。东洞庭湖国家级自然保护区，是中国湿地水禽的重要越冬地，也是重要繁殖地、停歇地，每年在这里栖息的雁、鸭等水鸟达数百万羽，是鸟类的天堂和乐园。

'''保护现状'''

东洞庭湖国家级自然保护区，生物多样性面临的主要威胁与过度捕捞有关。过度捕捞已经耗尽商业鱼类资源，也威胁到稀有鱼类种群和长江白稽豚。捕鱼行为干扰了越冬鸟种群。土地及资源利用也存在冲突。非法狩猎和偷猎，特别是冬季对野禽的投毒也时有发生。

'''洞庭威胁'''