叶恭绍，祖籍[[广东]]番禺，1908年11月7日出生于江西九江一个封建官僚的家庭。其祖父是清朝[[咸丰]]丙辰年（1856年）进士，翰林院庶吉士，历任户部云南司郎中，军机章京等职，有多部著作传世；其父是清朝[[光绪]]戊子年（1888年）举人，曾任江西知府，精通数学、诗词和书法；其二哥叶恭绰，早年追随[[孙中山]]先生，在 [[ 中华民国 ]] 临时革命政府任交通部长，后任 [[ 南京国民政府 ]] 交通部次长，是著名书法家。

叶恭绍的父辈们封建思想浓厚，重男轻女，不给女孩子接受高等教育的机会。叶恭绍冲破封建束缚，在二哥叶恭绰的帮助下，走出家庭接受新式教育，直到大学毕业。1927年，她由 [[ 天津 ]] 中西女子中学毕业后，考入 [[ 南开大学 ]] ，两年后转到北平 [[ 燕京大学 ]] 医预科学习。1930年，考入北平协和医学院，1935年毕业，获医学博士学位。