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臺南基地的軍用歷史十分出彩，[[第二次世界大戰]]期間，日軍除了從此處起飛參與菲律賓的戰鬥之外，臺南飛行場在戰爭後期也為美軍的重要轟炸目標。在軍事上，該機場除了先後為日本海軍航空隊（[[臺南海軍航空隊 (日本海軍)|臺南海軍航空隊]]、{{link-ja|第765海軍航空隊|第七六五海軍航空隊}}等）與中華民國空軍使用外，美國空軍亦曾使用該座機場參與越戰，並因兩岸局勢曾在此佈署過核彈{{r|蕭}}{{r|修}} 。由於這些經驗在先，2015年還接待過[[2015年美軍戰機降落臺南事件|美軍F-18備降修理]]。

[[臺灣日治時期]]除本場之外，另有兩處「臺南飛行場」，分別位在今天臺南市[[永康區]]與[[歸仁區]]{{r|杜}}<ref name="永"/> 。另外在二次大戰期間，美軍曾將臺南飛行場拼作「Eineisho Airport」（指「永寧庄機場」）{{r|杜}} 。以下行文在特別指稱日治時期民用的臺南機場將使用「臺南飛行場」一詞，轉為軍用後為與遷到永康的民用「臺南飛行場」區分，改用「臺南機場」一詞。