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通过近三年的努力，北京中心新建的14,000平方米大楼已全面启用，初步显现出一个现代化、高效的国家级研究中心的雏形。 北京中心通过采用全新运行机制，联合北京地区优势单位，吸引和培养了一大批优秀的中青年科技骨干，其中包括在学术上有突出造诣、在国内外产生较大影响的植物基因研究学科带头人，提升了我国植物功能基因的创新及转基因植物 <ref>[https://www.sohu.com/a/304106556_120055884 基因功能研究之转基因植物篇1（OE）]，搜狐，2019-03-27</ref> 研究的整体水平。

中心研究员朱玉贤教授采用转录组学、生物信息学、生物化学及植物生理学方法证实植物激素乙烯控制棉花纤维 <ref>[https://www.sohu.com/a/500227608_121124607 棉花品质决定棉纤维的使用性能，影响棉纱线的质量和纺织成本]，搜狐，2021-11-10 </ref> 伸长（Plant Cell，2006，18：651-664）。这是棉花纤维发育和细胞伸长机制研究中的一个重大突破，也是乙烯参与调控植物细胞伸长的最新证据。中心研究员瞿礼嘉教授研究证明IAA的甲基化在调节植物的发育和植物生长素的动态平衡上起重要作用（Plant Cell，2005，17：2693-2704），首次证明植物叶片的平展和发育涉及植物生长素活性的合理空间分布。中心研究员赵进东教授研究组对钙离子在蓝藻异型胞分化中的作用进行系统深入的研究（Proc. Natl. Acad. Sci. USA，2004，101：4848-4853；2005，102：5744-5748），证明钙离子对蓝藻异型胞分化有关键性调节作用。中心研究员许智宏院士和白书农教授共同主持的研究组提出组蛋白乙酰化是诱导根表皮细胞分化模式形成的“位置信息”的重要介导组分（Proc. Natl. Acad. Sci. USA，2005，102：14469-14474），为认识植物细胞模式形成机制提供了新的视角。目前，北京中心已申请专利44项，其中授权22项。 在转基因植物产业化方面，北京中心获得19种转基因植物安全证书。中心研究员于嘉林教授培育的抗小麦黄色花叶病病毒转基因小麦品系H55已获准进行大田试验，这是我国目前唯一被批准进入生产性试验的转基因小麦。这一系列原创性成果对我国农业生物技术领域的整体研究和应用水平起到极大的推动作用。