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宣统二年（1910年）缪荃孙奉调去北京，在创办京师图书馆任正监督期间，亲自清理秘阁藏书，分类清理内阁大库珍本，纂成《善本书目》8卷，《各省志书目》4卷等，时江苏议修通志，被延为总纂，定例分授协纂诸人，定期编辑。同时，广购图书馆古籍，集刻京师藏书目录。，1912年，民国成立后，他移居上海，继续从事目录学的研究，著书立说，前后撰有《艺风堂文集》、《艺风堂藏书记》、《艺风堂友朋书扎》、《清学部图书馆善本目录》、《清学部图书馆方志目》、《艺风堂金石文字目》、《南北朝名臣年表》、《近代文学大纲》等，不下二百余卷。戊申（1908年）张之洞负责学部，奏请缪荃孙调北京创办京师图书馆，任馆长之职，时图书馆尚未建造，暂时借城北积水潭广化寺为储书之所，同时，筹备基建，聘请馆员，一手创成京师图书馆，并重价购买了姚觐元的私人藏书，以充实京师图书馆之藏书。辛亥革命爆发后，缪荃孙辞归南返，寓居上海后，他仍建议并协助盛宣怀在沪搜辑《常州先哲遗书》，创建愚斋藏书楼，刊印《愚斋府稿》，广收图书，从而保存了大量古籍。并倡结诗社，整理旧籍，购书刻书，自己节衣缩食，创建艺风堂，藏书金石古董11000件，保护了大量古籍、古董不致流失，为后人保存了大量精神财富，显示了一位爱国者的高尚情操。纵观缪荃孙之一生，他不仅是一位博学通儒，著作等身，其学问造诣是多方面的，不愧为是历史学家、方志学家、目录学家、藏书家、金石家、教育家，更重要的是他在中国图书事业上有着不可磨灭的贡献。任何时代、任何社会，人们研究学问，问津科技，都离不开图书，书籍几乎成了文化与学术的同义词。缪荃孙创办了南北两京图书馆，自己创建了艺风堂，为盛宣怀创造了愚斋藏书楼，他是中国近代图书馆事业的奠基人，誉称为中国近代图书馆之父。<ref>[http://unn.people.com.cn/GB/22220/39486/39487/39719/2934500.html 著名学者、方志学家——缪荃孙],人民网</ref>