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中国环境监测总站编制为190人，截止2018年六月，在编 187 人，其中[[中国工程院]]院士 1 名，研究生学历以上人员占 78%， 45 岁以下年轻职工占 78%，在职党员占 77%。内设 18个处室，形成了由业务、[[技术]]、质控、管理四个模块合理搭配的工作布局。

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