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陈慰峰从事胸腺内T[[淋巴细胞]] <ref>[https://www.sohu.com/a/251564238_100196169 趣谈外周血细胞之淋巴细胞 ]，搜狐，2018-09-03</ref> 分化研究，开展肝癌免疫研究，克隆鉴定出新的肿瘤－睾丸抗原及肿瘤特异抗原编码基因证明肝癌患者对肿瘤抗原有免疫应答。

在理论免疫学研究中，他系统揭示了胸腺髓质型胸腺细胞的功能发育程序，此程序障碍会致免疫缺陷及自身免疫病。在应用研究中，他发现增殖T细胞分化为效应T细胞过程中需要分化因子，白细胞介素10（IL-10）即为杀伤T细胞分化因子。在肿瘤免疫研究中，他克隆鉴定出众多肿瘤抗原，并在[[中国]]第一个研制成具有明确抗原靶点的肿瘤[[疫苗]] <ref>[https://www.sohu.com/a/252137400_307557 肿瘤疫苗：几番浮沉，终得“新生” ]，搜狐，2018-09-05</ref> 。他发现的肿瘤-胎盘（CP）抗原，开辟了肿瘤抗原的新领域并有应用潜能。