這棟新建築取代了另座神廟：俗稱舊帕德嫩的赫卡托巴恩（Hekatompedon，意思是千座牆基，奉祀[[雅典娜·波麗亞斯]]），新神廟可能就蓋在舊神廟旁邊（詳細請閱[[舊帕德嫩神廟]]的獨立條目）。公元前5世紀中葉，雅典衛城成為[[提洛同盟]]的核心，雅典更是當時最大的文化重鎮，[[伯里克利]]開始著手一個很有野心的建築計劃，時程幾乎涵蓋公元前5世紀的後半之多，現代在雅典衛城所能看到最重要的建築物如帕德嫩神廟、山門（Propylaia）、[[厄瑞克忒翁神庙]]、雅典娜-[[尼刻]]的神殿都是興建於那個時期。帕德嫩由[[菲迪亞斯]]監造且負責彫刻裝潢，[[建築師]][[伊克蒂諾斯]]和[[卡利克拉提斯]]從公元前447年開始動工，廟體大約在公元前432年完成，不過裝潢至少到公元前431年才完工。有一些帕德嫩的財政帳簿留存至今，從中可知最大的單一營建成本，是將石頭從距雅典約16公里遠的[[彭特利庫斯山]]運到衛城。這些資金部份提撥自提洛同盟的金庫，在公元前454年從[[提洛島]]送到衛城。