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20日，郑军先和清军交战，并占了上风。待荷军抵达时，郑军为避免与荷军强大的火力作正面冲突，遂放弃厦门，往南撤退。郑军依靠灵活的船只，强行突破荷军舰队，只有3艘船被俘虏，其余皆平安撤离战场。战后郑军退守铜山，清军则趁机攻陷了金门、厦门，摧毁城砦、民舍，并残杀劫掠岛上居民。