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嗜鹽菌
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[[File:嗜鹽菌.jpg|230px|thumb|有框|右|嗜鹽菌[https://sites.google.com/site/rocketeuryarchaeotes15/home/extremely-halophilic-archaea 原圖鏈接]]]
嗜鹽菌(Halophile),是在高[[鹽]]濃度下茁壯成長的極端[[微生物]]細菌。在鹽濃度比[[海洋]]高五倍的[[水]]體中可以發現嗜鹽菌,例如猶他州的大鹽湖 ,[[加利福尼亞州]]的歐文斯湖,[[死海]]以及蒸發池中。
==分類==
[[File:Halophiles deadsea.jpg|230px|thumb|有框|右|死海的嗜鹽菌Halophiles_deadsea[https://thebiologist.rsb.org.uk/biologist-features/158-biologist/features/1726-salt-survivors 原圖鏈接]]]
嗜鹽菌按其耐鹽性的程度進行分類:輕微,中度或極端。
嗜鹽菌利用多種能源,可以是有氧的或厭氧的。[[厭氧]]嗜鹽菌包括光養型,發酵型,[[硫酸鹽]]還原型,均[[乙酸]]型和產[[甲烷]]型。
Haloarchaea,特別是Halobacteriaceae科,是Archaea領域的成員,在高鹽環境中佔原核生物的大多數。目前,該家族中有15個公認的屬。細菌域(主要是紅桿菌 )可以佔原核生物群落的25%,但更常見的是其在總人口中所佔的比例要低得多。<ref> [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC92110/ 來自太陽能鹽廠的結晶池中的極端嗜鹽細菌]美國國家醫學圖書館/應用與環境微生物學</ref>有時,藻類杜氏鹽藻也可以在這種環境中繁殖。<ref>Casamayor EO,Massana R,Benlloch S,ØvreåsL,DíezB,Goddard VJ,Gasol JM,Joint I,Rodríguez-ValeraF,Pedrós-AlióC(2002)。 “通過比較多池太陽鹽罐中的遺傳指紋方法,沿鹽度梯度改變了古細菌,細菌和真核生物的組合。”環境微生物學。
4 (6):338–348 </ref>
===居住在結晶池中的原核社區===
==基因組和蛋白質組學簽名==
比較的基因組和蛋白質組學分析表明,嗜鹽菌的環境適應性存在明顯的分子特徵。 在蛋白質水平上,該嗜鹽菌種的特徵是疏水性低,酸性殘基的過量表達,Cys的表達不足,較低的螺旋形成傾向和較高的螺旋結構傾向。 這些蛋白質的核心疏水性較小,例如DHFR ,發現其具有較窄的β鏈。在DNA水平上,嗜鹽菌表現出不同的二核苷酸和密碼子用法。<ref> [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2643941/ 高鹽適應的分子特徵:嗜鹽原核生物的基因組和蛋白質組組成的見解]基因組生物學</ref>
==範例==
# 嗜鹽菌科是包括嗜鹽古細菌很大一部分的家族。 [12] 鹽桿菌屬對其具有較高的鹽度耐受性。一些鹽桿菌具有酸性[[蛋白質]],可以抵抗鹽的變性作用。鹽球菌是鹽桿菌科的另一個屬。
# 一些高鹽湖是眾多嗜鹽菌家庭的棲息地。 例如, 博茨瓦納的Makgadikgadi Pans形成了一個巨大的季節性高鹽度水體,表現出芽孢 桿菌科的矽藻屬Nitzschia內的嗜鹽菌種以及鞭毛科的Lovenula屬的菌種 。加利福尼亞的歐文斯湖也含有大量嗜鹽細菌Halobacterium halobium 。
# Wallemia ichthyophaga是一種擔子菌真菌 ,在體外生長需要至少1.5 M的氯化鈉 ,即使在鹽飽和的培養基中也可以生長。 <ref> [Zalar P,Sybren de Hoog G,Schroers HJ,Frank JM,Gunde-Cimerman N(2005年5月)。 “嗜幹菌屬Wallemia的分類和系統發育(Wallemiomycetes和Wallemiales,cl。et ord。nov。)”。 安東尼•範•列文虎克(Antonie van Leeuwenhoek) 。 87 (4):311–28</ref>鹽的強制性要求是真菌的例外。 在幾乎所有情況下,即使是能夠耐受鹽濃度接近飽和的物種(例如Hortaea werneckii ),也都可以在標準微生物培養基中生長,而無需添加鹽。
# 鹹味食物(例如[[醬油]] ,大中華豆,咸[[鱈魚]],咸鳳尾魚,[[酸菜]]等)的發酵通常涉及嗜鹽菌,它們是必需成分或偶然污染物。一個例子是嗜鹽桿菌 ( Beijerinckii),發現於醃製在鹽水中的鹹豆和鹹鯡魚中。在鹽醃的鳳尾魚和醬油中發現了嗜鹽四核球菌 。
# 鹵蟲是生活在鹽湖(例如[[大鹽湖]])和太陽鹽湖中的小型嗜鹽[[甲殼類動物]]的普遍存在,它們可以存在於接近NaCl沉澱點(340 g / L)的水中<ref> [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3381296/ 鹽水蝦鹵蟲:適應關鍵的生活條件]美國國家醫學圖書館/生理學前沿</ref><ref>De Vos S,Van Stappen G,Vuylsteke M,Rombauts S,Bossier P(2018)。 “使用鹵蟲轉錄組鑑定鹽脅迫應答基因”。水產養殖。500:305–31417] </ref>。滲透性休克是由於其緩解鹽度水平波動的策略所致,例如其獨特的幼體鹽腺和滲透調節能力。