|總統||副總統||票數||得票率||票數||票數||得票率||
|- align="left"
|{{dpp}} 民進黨 [[陳水扁]]||{{dpp}} [[呂秀蓮]]||6,471,970||50.11%||6,446,900||6,461,177||50.10%||[[File:Vote1.svg|20px]]
|- align="left"
|{{kmt}} 國民黨 [[連戰]]||{{pfp}} [[宋楚瑜]]||6,442,452||49.89%||6,423,906||6,435,614||49.90%||
|}