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治療黴漿菌肺炎簡單直接的方式就是使用紅黴素，但是過去在台灣曾經引起醫師間的軒然大波，根據早期台灣數據資料顯示，只有10到14％的病人對紅黴素有抗藥性，但近期臺灣竟然有高達7成的病人對於治療第一線抗生素紅黴素已產生抗藥性，對第二線抗生素（巨環黴素）有12到23％左右的抗藥性。這是不容忽視的問題。早在第二次世界大界期間，抗生素就已經問世了。隨著時間的轉變，抗生素現今唾手可得，帶給人們數不盡的好處。

但是也因取得抗生素的便利，不論是感冒發燒、發炎感染等等，大部分醫師都會開抗生素，雖然效果顯著，但濫用抗生素卻是被忽視的嚴重問題。不光是醫療，連食安也中標。國內的食安危機也與抗生素有關，法務部表示各國的肉品間抗生素殘留與耐藥性細菌會相互流通，沒有任何國家能置身事外，亦即這是一件全球性的危機，我國雖已明定禁止使用的抗生素種類，甚至由2000年至今已刪減了三十四種藥品，但於畜禽水產品殘留動物用藥檢測中，卻仍持續檢出禁藥。