生態學數據分析·方法程序與軟件
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《生態學數據分析·方法程序與軟件》，郭水良，於晶，陳國奇 著，出版社： 科學出版社。
內容簡介
《生態學數據分析：方法、程序與軟件》介紹了生態學數據處理方法，包括數據轉換和標準化、物種和遺傳水平的多樣性、種群空間分布格局、生態位、聚類分析、主成分分析、除趨勢對應分析、典範對應分析、基於*大熵模型的物種分布區預測，以及生態學實驗中的單因素與雙因素方差分析、成對樣本T-檢驗、獨立樣本T-檢驗等。對於每一種方法，提供了相應的程序和軟件，《生態學數據分析：方法、程序與軟件》的重點不是介紹生態學數據處理方法的理論基礎和數學公式推導，而是在簡要介紹方法的基礎上，利用案例數據，手把手地教大家如何利用《生態學數據分析：方法、程序與軟件》介紹的程序和軟件實現數據定量分析。可作為生態學、環境科學[1]及其他相關領域（例如植物學、動物學、農學和土壤科學）本科生和研究生的教材，也可作為相關專業科研人員的自學參考書。
目錄
前言
第一章生態學數據收集
第一節樣方設置
一、主觀取樣
二、客觀取樣
第二節樣方形狀、大小和數目
一、樣方的形狀
二、樣方的大小
三、樣方的數目
第三節無樣地取樣法
第二章群落數量和環境特徵
第一節群落的數量特徵
一、多度
二、密度
三、蓋度
四、頻度
五、高度
六、生物量和產量
七、優勢度和生態重要值
八、生活型
九、種一面積曲線和群落最小面積
第二節環境特徵
一、氣候數據
二、地形數據
三、土壤數據
四、水體環境
五、生物因子數據
第三章數據準備
第一節數據的類型
一、名稱數據
二、順序性數據
三、數量數據
四、數據矩陣[2]
第二節數據預處理
一、數據簡縮
二、數據轉換
三、數據標準化
第三節QBASIC編程
第四章回歸分析
第一節應用Curvet：xpert進行函數擬合
一、CurveExpert軟件簡介
二、操作步驟
第二節應用SPSS進行曲線擬合
第三節運用Excel電子表格進行變量關係擬合
第四節多元線性回歸
第五章多樣性指數計算
第一節生物多樣性概述
第二節遺傳多樣性
一、取樣方法
二、遺傳多樣性標記介紹
三、分子數據分析方法
四、應用Popgen32計算群體遺傳多樣性和分化
第三節物種多樣性
一、物種多樣性的概念
二、a物種多樣性計算公式
三、饢鎦侄嘌約撲愎?
四、物種多樣性的計算程序和軟件
第六章種間關係分析
第一節相關分析
一、連續數據的相關性分析
二、二元數據的雙系列相關係數
第二節種間關聯
第三節種間相關
一、Pearson相關係數
二、Spearman秩相關係數
三、應用SPSS計算Pearson和Spearman秩相關係數
四、應用PAST計算Pearson相關係數和Spearman秩相關係數
五、應用QBASIC程序計算變量之間的相關性
第七章生態位
第一節生態位概念
第二節生態位指數計算
一、生態位寬度
二、生態位重疊值
第八章空間格局分析
第一節空間格局的概念
第二節分布格局類型的判定方法
一、方差均值比
二、X2檢驗
三、煅é
四、Morisita指數
五、CA擴散指數
六、平均擁擠度
第三節格局分析方法
一、單種格局規模分析
二、種群分布格局的斑塊間隙、斑塊大小分析
第九章群落數量分類方法
第一節分類的目的和意義
第二節相似係數和相異係數
一、僅適合二元數據的相似關係
二、適用於二元數據和數量數據的相似關係
第三節等級聚類方法
一、等級聚類的一般步驟
二、應用PCORD軟件進行聚類分析
三、應用PAST軟件進行聚類分析
四、應用SPSS進行聚類分析
第四節等級劃分法
一、單元劃分法，
二、雙向指示種分析法
第五節非等級分類方法
一、相似分類法
二、相異分類法
三、圖論聚類法
第十章排序
第一節排序概述
第二節極點排序
一、方法簡介
二、應用PCORD進行極點排序
第三節主成分分析
一、主成分分析概述
二、主成分分析的原理
三、計算步驟
四、應用SPSS11.0進行主成分分析
五、應用PAST2.17進行主成分分析
六、應用PCORD進行主成分分析
第四節主坐標排序
一、方法介紹
二、應用PAST進行主坐標排序
第五節對應分析和除趨勢對應分析
一、對應分析
二、除趨勢對應分析
三、應用PAST進行對應分析和除趨勢對應分析
四、應用PCORD進行對應分析和除趨勢對應分析
第六節典範對應分析和除趨勢典範對應分析
一、典範對應分析
二、除趨勢典範對應分析
三、應用PAST進行典範對應分析
四、應用Canoco進行典範對應分析和除趨勢典範對應分析
五、應用PCORD進行典範對應分析和除趨勢典範對應分析
第七節無度量多維標定排序
一、方法
二、應用PAST和PCORD進行無度量多維標定排序
第十一章生理生態學中數據統計分析
第一節單因素方差分析
第二節雙因素方差分析
第三節獨立樣本￡檢驗和成對樣本￡檢驗
一、獨立樣本￡檢驗
二、成對樣本￡檢驗
第四節重複測量數據的方差分析
第五節實驗結果的圖表形式
一、三線表
二、應用Excel作圖的技巧
第十二章應用R語言進行生態數據分析
第一節R語言簡介
一、R語言的下載和安裝
二、R程序的一般運行方法
三、R語言中的基本語句
四、R語言中重要的生態與環境統計學程序包
第二節數據標準化程序
第三節二元數據的相似係數矩陣程序
第四節圖解相關係數矩陣的程序
一、程序
二、運算結果
第五節用R語言計算物種多樣性指數
一、a多樣性的計算
二、舛嘌約撲慍絛ò
第六節應用R語言進行數量分類
一、建立相異係數矩陣的程序
二、構建聚類樹的程序
三、圓形聚類樹狀圖的方法
四、聚類和熱圖的構建方法
五、最小生成樹
第七節應用R語言進行多元回歸樹構建
第八節C一均值模糊聚類分析
第九節應用R語言進行生態位分析
第十節應用R語言進行排序分析
一、排序程序
二、組合聚類和排序的方法
三、典範對應分析、對應分析、除趨勢對應分析和約束排序分析程序
四、非度量多維標定
五、偏約束排序分析
第十一節R語言在構建決策樹模型中的應用
第十二節應用R語言繪製圖形的方法介紹
一、基本作圖語句
二、用R語言生成熱圖
三、排序二維散點圖
四、排序的三維散點圖
參考文獻
有關軟件的參考文獻