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林魁

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人物說明----北京師範大學教授、博士生導師 民 族 ---- 漢族 出生日期----1963年7月 國 籍 ---- 中國 職 業 ---- 教育科研工作者 畢業院校----蘭州大學 職   稱 ---- 教授 職   務 ---- 博士生導師 畢業院校----蘭州大學 學位/學歷----博士

林魁，男，漢族，博士，1963年7月出生，北京師範大學生命科學學院教授、博士生導師。

目錄

1人物經歷 2研究方向 3主要貢獻

人物經歷

1983年本科畢業於蘭州大學數力系；1990年蘭州大學理學碩士畢業（應用數學）；1997年蘭州大學理學博士畢業（理論生態學）；1998年1月－1999年1月在新加坡國立大學生物信息學中心(BIC, NUS)作博士後；1999年2月－2000年1月在新加坡國立大學生物信息學中心(BIC, NUS)工作(Research Fellow)；2000年2月－2001年10月在新加坡分子與細胞生物學研究院(Institute of Molecular & Cell Biology)工作(Research Fellow)；2001年11月－2002年8月在新加坡基因組研究院(Genome Institute of Singapore)工作(Research Scientist)；2002年8月至今，北京師範大學生命科學學院教授。林教授擔任北師大生命科學學院工會主席。

2005年之後，林魁教授科研成績卓越，以通訊作者身份分別在Trends in Genetics，Nucleic Acid Research和Ecology等國際超一流雜誌上發表多篇論文，在研究界取得巨大反響。2009年，林魁教授小組還合作在Nature Genetics上發表研究論文。

研究方向

微生物基因組的進化：主要利用微生物基因組特別是原核生物基因組內普遍存在的重疊基因作為遺傳標記，同時結合其它系統發育標記在全基因組水平上進行基因組間進化關係的系統發育分析。

主要貢獻

蛋白與蛋白相互作用網絡的構建與分析：在全基因組水平上設計新的計算和分析方法，構建高質量的網絡並同時得到高可靠性的負數據集。該方法已成功應用於酵母菌基因組；

蛋白質相似性比較分析：在蛋白質結構域架構（Protein Domain Architecture）的水平上設計算法進行蛋白質相似性比較研究，試圖在基因的水平上探討結構域架構間的進化關係。

此外，林魁教授的研究還涉及到微生物群落基因組學、人類基因組中遺傳變異數據的分析、真核生物內含子進化以及microRNAs與其靶基因間的關係等問題。

Wu, X.M., Zhu, L., Guo, J., Fu, C., Zhou, H.J., Dong, D., Li, Z.B., Zhang, D.Y. and Lin, K. (2006) SPIDer: Saccharomyces protein-protein interaction database. BMC Bioinformatics 7, S16.

Luo, Y.Q., Fu, C., Zhang, D.Y. and Lin, K. (2006) Overlapping genes as rare genomic markers: the γ-Proteobacteria phylogeny as a case study. Trends in Genetics 22(11): 593-596.

Lin, K., Zhu, L. and Zhang, D.Y. (2006) An initial strategy for comparing proteins at the domain architecture level. Bioinformatics 22(17): 2081-2086.

Wu, X.M., Zhu, L., Guo, J., Zhang,D.Y. and Lin, K. (2006) Prediction of yeast protein-protein interaction network: insights from the Gene Ontology and annotations. Nucleic Acids Research 34(7): 2137-2150.

Lin, K. and Zhang, D.Y. (2005) The excess of 5' introns in eukaryotic genomes. Nucleic Acids Research 33: 6522-6527.