遗传图谱查看源代码讨论查看历史

         

遗传图谱

[1]http://pic.sogou.com/d?query=%E9%81%97%E4%BC%A0%E5%9B%BE%E8%B0%B1&forbidqc=&entityid=&preQuery=&rawQuery=&queryList=&st=&did=3搜狗 的图片

遗传图谱是某一物种的染色体图，显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。由遗传重组测验结果推算出来的、在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列（基因位点的排列）图。

Genetic map，遗传图或遗传连锁图是以基因连锁、重组交换值构建的图谱，图距为cM（厘摩），1%交换值为1cM，约相当于1000kb。人基因组全长约3300cM，如两个标记之间相距1cM，则需3300个标记，如相距2～5cM，则需660～l650个标记。标记可以是体质性状，也可以是可检出的DNA序列，例如基因、限制片段长度多态性（RFLP）和特定的单一序列等。每一个标记都要用专一序列位点（STS）作鉴定。STS是指其位置及核苷酸序列均已知的、人基因组中只有一份拷贝的DNA短片段（一般长200～500碱基对），它很容易用多聚酶链反应（PCR）加以验证。当各个实验室报道定位和测序的数据时，可用STS来确定这些DNA片段的定位与取向。人类基因组计划的研究目标是，完成一个完全连接的人类遗传图，标记之间平均相距2～5cM。

基本信息

遗传图谱即遗传连锁图谱，是基因组研究中的一个重要组成部分，它是指基因组中基因以及专一的多态性标记之间相对位置的图谱。即通过两点测验和三点测验对统计的各种带型个体数进行连锁分析计算，建立连锁群。也可从第二个标记开始，测验与前一个标记是否协同分离。根据分离资料，用最大似然法估计不同标记位点间的重组率数值并转换成遗传距离，连锁的遗传标记间距离，一般用cM表示，1cM为同源染色体配对期望交换值1%的染色体长度。随着计算机技术的发展，已有多个构建遗传图谱的软件，研究者用的较多的软件主要有MapMaker及JoinMap 3.0 。

遗传分析

通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图。它是通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率，确定他们的相对距离，一般用厘摩来表示。绘制遗传连锁图的方法有很多，但是在DNA多态性技术未开发时，鉴定的连锁图很少，随着DNA多态性的开发，使得可利用的遗传标志数目迅速扩增。早期使用的多态性标志有RFLP（限制性酶切片段长度多态性）、RAPD（随机引物扩增多态性DNA）、AFLP（扩增片段长度多态性）；80年代后出现的有STR（短串联重复序列，又称微卫星）DNA遗传多态性分析和90年代发展的SNP（单个核苷酸的多态性）分析。利用遗传图谱可以对多种疾病及性状进行遗传分析与基因定位。

作图群体

建遗传图谱的遗传材料是分离群体，即作图群体。按其遗传稳定性可分为两大类：一是非固定性分离群体或暂时性群体(F2、F3、F4、BC群体、三交群体)，其最主要的特点是易于在短期内构建具充足大小的作图群体。二是永久性或固定性的作图群体，DH和RIL为永久性的作图群体，它们克服了暂时性群体的不足之处，但构建这样的群体不是难度大，就是耗时长。

植物图谱构建

1、亲本选择差异大，子代可稳定遗传的

2、亲本的标记及差异选择

3、作图群体构建以及分子标记检测

4、连锁分析：两点测验、三点测验（软件：MAPMAKER）

5、遗传标记的染色体定位