蛋白質組學國家重點實驗室

蛋白質組學國家重點實驗室依託中國人民解放軍軍事醫學科學院（由軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所主建），實驗室在開展人類重要生理功能與重大疾病蛋白質組學研究。

簡要概況

非常重視具有自主知識產權^[1]的核心技術的研發，在此方面通過國內外合作，近期取得系列重要進展，4項成果最近相繼發表於國際核心刊物《分子與細胞蛋白質組學》（Molecular & Cellular Proteomics）、《自然－方法》（Nature Methods）和《自然－實驗手冊》（Nature Protocols）。

鑑定策略

創建了核心岩藻糖化蛋白質規模化精確鑑定策略，糖基化蛋白質的核心岩藻糖化修飾既參與多種重要生理過程（如轉化生長因子-β1和表皮生長因子信號通路等）的調節，也與多種疾病特別是癌症（如肝癌、胰腺癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌等）密切相關。在疾病診斷上，越來越多的研究表明，監測某些糖基化蛋白質核心岩藻糖化形式的表達水平變化，較檢測這些蛋白質的總體表達水平變化，具有更好的特異性和靈敏度。但現有的糖蛋白質組學研究方法無法實現核心岩藻糖化蛋白質的規模化鑑定，因而限制了該類糖蛋白^[2]作為疾病標誌物的有效篩選。為解決此問題，該實驗室錢小紅研究員課題組與中國科學院計算技術研究所賀思敏研究員課題組等合作，通過發展和優化目標糖肽富集方法、中性丟失依賴的三級質譜採集方法、不依賴數據庫的圖譜篩選方法和圖譜優化方法，建立了一種規模化、精確鑑定核心岩藻糖化蛋白質的嶄新策略，並經過臨床樣本的檢驗。結果表明，該研究策略不但鑑定結果可信度高，而且鑑定蛋白質及其修飾位點的數目均超過以往文獻報道方法的4－6倍，實現了在複雜血漿體系中的規模化鑑定。相關工作近期發表於國際蛋白質組學頂級刊物《分子與細胞蛋白質組學》。作為國際上第一個專門用於核心岩藻糖化蛋白質規模化精確鑑定的策略，人們預計它將在腫瘤標誌物篩選中發揮重要作用。

視頻