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国家基因组科学数据中心针对我国基因组学数据“存管用”的实际需求以及“数据孤岛”、“数据主权”的重大问题,国家基因组科学数据中心(以下简称“中心”)围绕人、动物、植物、微生物基因组数据,重点开展数据资源及数据库体系建设,并开展数据服务、系统运维、技术研发、数据挖掘等系列工作。

机构简介

该中心依托中国科学院北京基因组研究所,联合中国科学院上海营养与健康研究所和中国科学院生物物理研究所共同建设,上级主管部门为科技部基础司和中国科学院。中心设立管理委员会[1]、专家委员会和用户委员会,建立中心运行管理机制,实行主任负责制,全面负责运行和管理工作。中心组建70人左右的科学数据专业化团队,提供基因组学数据统一存储、整合挖掘、共享应用的一站式数据服务,成为有国际影响力的基因组科学数据中心。

数据情况

资源简介

中心已发布15大数据资源体系、40个数据库,涵盖生物项目数据、生物样本数据、组学原始数据、基因组序列、基因组变异数据、生物信息工具等,形成了重要的国际影响力。

资源体系

多组学生物大数据[2]

特色资源

组学原始数据归档库

数据服务

服务方式

中心已形成基因组学科学数据汇交、共享、分析、检索、下载的全面服务系统,开展数据汇交一站式服务,包括在线递交、FTP上传递交等汇交模式;可提供全方位基因组学数据共享服务,方便用户在线数据访问和共享,FTP下载以及API接口交互式共享访问。

数据特色

人类遗传资源信息

人类遗传资源,特别是一些大规模人群队列、重要家系如长寿遗传家系、特定地区家系如高原人类遗传资源家系等,关乎公众健康、国家安全和社会公共利益,是重要的国家战略资源。GSA for Human旨在收集、存储与管理人类遗传资源原始序列数据,目的是建成人类遗传资源数据共享平台,保障国家人类遗传数据资源安全。

参考文献