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{| class="wikitable" style="float:right; margin: -10px 0px 10px 20px; text-align:left" |<center>'''朱怀球 '''<br><img src=" https://yuanpei.pku.edu.cn/images/content/2020-09/20200902150125919674.png " width="180"></center><small>[https://yuanpei.pku.edu.cn/ypds/dsfc/499266.htm 北京大学元培学院] </small> |} '''朱怀球''',男,北京大学元培学院教授。 ==研究方向== 生物信息学与系统生物学 生物医学大数据 微生物基因组学 基因组医学 ==教育经历== 2000年 北京大学 流体力学专业,湍流与计算流体力学方向,博士 1997年 北京大学 流体力学,爆炸力学与流体力学方向,硕士 1992年 华中科技大学 工程力学 学士 ==获奖情况== 2018年 北京大学教学优秀奖 2017年 北京大学首届教学优秀奖(研究生部分) 2011年 全国优秀博士论文提名奖(指导导师) 2011年 北京大学优秀博士论文二等奖(指导导师) 2010年 北京市优秀博士论文奖(指导导师) 2007年 中国生物医学工程联合学术年会青年优秀论文奖 2006-2010年 先后获北京大学宝洁奖教金奖、北京大学埃克森-美孚奖教金、北京大学方正优秀奖教金奖 ==学术成果== === 论文及专著 === * Fang ZC, Tan J, Wu SF, Li M, Xu CM, Xie ZJ, Zhu HQ*. PPR-Meta: a tool for identifying phages and plasmids from metagenomic fragments using deep learning. GigaScience, 2019, DOI: 10.1093/gigascience/giz066 * Jiang XQ, Li X, Yang LS, Liu CH, Wang Q, Chi WL, Zhu HQ*. How Microbes Shape Their Communities? A Microbial Community Model Based on Functional Genes. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2019, 17(1): 91-105. * Yang C, Yang LS, Zhou M, Xie HL, Zhang CJ, Wang MD, Zhu HQ*, LncADeep: An ab initio lncRNA identification and functional annotation tool based on deep learning. Bioinformatics, 2018, 34(22): 3825-3834. * Zhai P, Yang LS, Guo X, Wang Z, Guo JT, Wang XQ, Zhu HQ*. MetaComp: comprehensive analysis software for comparative meta-omics including comparative metagenomics. BMC Bioinformatics, 2017, 18: 434. * Liu YX, Zhang L, Wang XQ, Wang Z, Zhang JJ, Jiang RH, Wang XQ, Wang K, Liu ZJ, Xia ZW, Xu ZJ, Nie Y, Lv XL, Wu XL, Zhu HQ*, Duan LP*. Similar fecal microbiota signatures in patients with diarrhea-predominant irritable bowel syndrome and patients with depression. Clin. Gastroenterol. H., 2016, 14(11): 1602-1611. * He FF, Li Y, Tang YH, Ma J*, Zhu HQ*. Identifying micro-inversions using high-throughput sequencing reads. BMC Genomics, 2016, 17(Suppl 1): 4. * Lai BB, Wang FM, Wang XQ, Duan LP, Zhu HQ*. InteMAP: Integrated Metagenomic Assembly Pipeline for NGS Short Reads. BMC Bioinformatics, 2015, 16: 244. * Guo JT, Wang Q, Wang XQ, Wang FM, Yao JX, Zhu HQ*. Horizontal gene transfer in an acid mine drainage microbial community. BMC Genomics, 2015, 16: 496. * Wang XQ, Wang Q, Guo X, Liu LY, Guo JT, Yao JX, Zhu HQ*. Functional genomic analysis of Hawaii marine metagenomes. Sci. Bull., 2015, 60(3): 348-355 * Liu YC, Guo JT, Hu GQ, Zhu HQ*. Gene prediction in metagenomic fragments based on the SVM algorithm. BMC Bioinformatics, 2013, 14(S5): S12. * Lai BB, Ding RG, Li Y, Duan LP, Zhu HQ*. A de novo metagenomic assembly program for shotgun DNA reads. Bioinformatics, 2012, 28(11): 1455-1462. * Zheng XB, Hu GQ, She ZS, ZhuHQ*. Leaderless genes in bacteria: clue to the evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes. BMC Genomics, 2011, 12: 361. * Luo CW, Hu GQ, Zhu HQ*, Genome reannotation of Escherichia coli CFT073 with new insights into virulence, BMC Genomics, 2009, 10: 552. * Hu GQ, Guo JT, Liu YC, Zhu HQ*. MetaTISA: Metagenomic translation initiation site annotator for improving gene start prediction. Bioinformatics, 2009, 25(14): 1843-1845. * Hu GQ, Zheng XB, Yang YF, Ortet P, She ZS, Zhu HQ*. ProTISA: a comprehensive resource for translation initiation site annotation in prokaryotic genomes. Nucleic Acids Res., 2008, 36: D114-119. * Zhu HQ, Hu GQ, Yang YF, Wang J, She ZS. MED: a new non-supervised gene prediction algorithm for bacterial and archaeal genomes. BMC Bioinformatics, 2007, 8: 97. * Zhu HQ, Hu GQ, Ouyang ZQ, Wang J, She ZS. Accuracy improvement for identifying translation initiation sites in microbial genomes. Bioinformatics, 2004, 20(18): 3308-3317. ==承担项目== 1. 主持国家重点研发计划重点专项《重要疫源微生物组学研究》课题“微生物多组学生物信息新算法研究与平台构建(No. 2017YFC1200205)”(2017~2020) 2. 主持国家自然科学基金项目“微生物群落环境适应性的宏基因组学研究(No. 31671366)”(2017~2020) 3. 主持北京大学“建设世界一流大学(学科)和特色发展引导专项”临床医学+X项目“基于肠道微生物组学的多组学精准医学联合平台”(2017~2018) 4. 主持国家自然科学基金重大研究计划“极端微生物宏基因组微进化的计算生物学研究(No. 91231119)”(2013~2015) 5. 主持国家自然科学基金重点项目“神经影像的时间信息提取及其在中枢药物疗效检测中的应用(No. 61131003)”(2012~2016) 6. 负责国家重点基础研究发展计划(973计划)子课题“视觉假体的信息处理及编码理论研究(No. 2011CB707503)”(2011~2016) ==社会兼职== [[中国医药生物技术协会]]生物医学信息技术分会常务委员;[[中国生物工程学会]]计算生物学与生物信息学专业委员会委员;北京生物信息学研究会理事会秘书长;北京生物医学工程学会常务理事;《Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology》副主编;《北京生物医学工程》编委。<ref>[https://yuanpei.pku.edu.cn/ 北京大学元培学院]</ref> ==参考资料== {{reflist}} [[Category:教授]]
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