檢視实时荧光PCR技术的原始碼

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《'''实时荧光PCR技术'''》，主编李金明，出版社	科学出版社，版次	1，出版时间	2016年10月，开本	16，作者	无，装帧	圆脊精装，页数	512，字数	742，ISBN编码	9787030498274。

科学出版社是中国最大的综合性科技出版机构<ref>[http://news.sohu.com/a/791262769_121675507 国家对出版社等级是怎样评估的 ]，搜狐，2024-07-06</ref>，由前[[中国科学院编译局]]与1930年代创建的有较大影响的龙门联合书局合并而来。科学出版社比邻[[皇城根遗址公园]]，是一个历史悠久、力量雄厚，以出版[[学术]]书刊为主的开放式出版社<ref>[http://www.cspm.com.cn/gsgk2017/gsjj/ 公司简介]，中国科技出版传媒股份有限公司</ref>。

==内容简介==

本书在第1版基础上修订而成，分34章，系统阐述了实时荧光 PCR技术的基础理论和临床检测方法，包括临床 PCR技术的发展历史及趋势，实时荧光 PCR技术的基本原理和方法，临床 PCR实验室的设计及质量管理体系的建立，临床 PCR检验标本的采集、运送、保存及核酸提取，实时荧光 PCR测定的数据处理，实时荧光 PCR仪及其发展，临床 PCR检验仪器设备的使用、维护和校准，临床 PCR检验的质量保证，[[病毒]]核酸检测的标准物质及其应用，以及各型肝炎病毒、人免疫缺陷病毒G1、人乳头瘤病毒、巨细胞病毒、严重急性呼吸综合征冠状病毒、EB病毒、流感病毒、风疹病毒、麻疹病毒、手足口病病原体、埃博拉病毒、中东呼吸综合征冠状病毒、沙眼衣原体、结核杆菌、淋病奈瑟菌、幽门螺杆菌、肺炎支原体、刚地弓形虫、解脲支原体等实时荧光 PCR检测及临床意义、EGFR基因、KRAS基因、BRAF基因、 PIK3CA基因等实时荧光 PCR检测及临床意义.

==目录==

第1章临床PCR技术的发展历史及趋势(1)

第一节PCR的起源和耐热DNA聚合酶的应用(1)

一、PCR的起源(1)

二、耐热DNA聚合酶的应用(2)

第二节PCR的基本原理(3)

第三节PCR的反应动力学(5)

第四节PCR的扩增体系和扩增条件(5)

一、PCR扩增体系的基本要素(5)

二、PCR的标准扩增体系(8)

三、PCR扩增的增强剂(9)

四、降落PCR(9)

五、热启动PCR(10)

六、COLDGPCR(10)

七、PCR扩增结果分析(11)

第五节PCR的特点(12)

一、高特异性(12)

二、高[[灵敏度]](12)

三、简便快速(12)

四、特定的低纯度标本也可使用(12)

第六节PCR的发展(12)

参考文献(13)

第2章实时荧光PCR技术的基本原理和方法(14)

第一节发展历程(14)

第二节基本原理(15)

一、PCR扩增的理论模式(15)

二、实时荧光PCR的理论基础(16)

三、TaqMan实时荧光PCR的基本原理(17)

四、双链DNA交联荧光染料实时荧光PCR的基本原理(19)

五、双杂交探针实时荧光PCR的基本原理(20)

六、分子信标实时荧光PCR的基本原理(20)

七、蝎形探针实时荧光PCR的基本原理(21)

八、数字实时荧光PCR的基本原理(24)

第三节引物、探针的特点及设计软件(26)

一、引物的特点(26)

二、探针的特点(26)

三、引物和探针设计软件(27)

第四节多重实时荧光PCR(28)

参考文献(28)

第3章临床PCR实验室的设计及质量管理体系的建立(30)

第一节实验室的分区规划设计(30)

一、标本的接收(30)

二、实验室分区设计的一般原则及工作流程(31)

第二节实验室质量管理体系的建立(39)

一、实验室质量管理概述(39)

二、实验室质量管理的特点(41)

三、质量体系文件的编写(42)

第三节实验室的记录管理(56)

一、记录的种类(56)

二、记录的标识(56)

三、记录的填写(57)

四、记录的封面和目录(59)

五、记录的良好保存(59)

六、记录的保存期限(59)

七、过期记录的处理(59)

八、记录表格样式的持续改进(59)

九、电子记录的管理(60)

第四节实验室验收与实验室认可(60)

一、实验室认可的由来及目的(60)

二、实验室认可与认证的区别(61)

三、实验室验收与实验室认可的关系(61)

参考文献(62)

第4章临床PCR检验标本的采集、运送、保存及核酸提取(63)

第一节标本采集、运送、保存(63)

一、标本采集(63)

二、标本运送(65)

三、标本保存(65)

第二节常见临床标本的处理和保存(66)

一、血清(浆)样本(66)

二、全血样本(66)

三、外周血单个核细胞(66)

四、痰(66)

五、棉拭子(67)

六、脓液(67)

七、体液(68)

八、乳汁(68)

九、组织(69)

第三节临床标本中PCR抑制物(70)

一、临床标本中PCR抑制物的来源及作用机制(70)

二、几种常见抑制物的作用机制及对策(70)

第四节核酸的提取方法(72)

一、DNA提取的经典方法(72)

二、RNA的提取(73)

三、核酸提取的改良方法(74)

参考文献(78)

第5章实时荧光PCR测定的数据处理(83)

第一节基本概念(83)

第二节实时荧光PCR外标**定量的数学模型(85)

一、基本计算公式的推导(85)

二、纵坐标为起始拷贝数对数值横坐标为Ct时的数学模型(85)

三、纵坐标为Ct横坐标为起始拷贝数时的数学模型(86)

第三节实时荧光PCR相对定量的数学模型(87)

一、相对定量的标准曲线法(87)

二、2-ΔΔCt法(89)

三、2-ΔΔCt的改良方法(89)

四、多重PCR法(91)

第四节用曲线拟合的方法进行数据处理(92)

一、Liu与Saint的方法(92)

二、Ramakers等的方法(92)

三、Tichopad等的方法(92)

参考文献(93)

第6章实时荧光PCR仪及其发展(94)

第一节PCR仪的发展历史及基本原理(94)

一、空气驱动循环PCR仪(94)

二、变温金属块PCR仪(95)

第二节实时荧光PCR仪简介(95)

一、美国ABI公司生产的实时荧光PCR仪(95)

二、美国Cepheid公司的SmartCycler实时荧光PCR仪(98)

三、美国BioGRad公司的实时荧光PCR仪(99)

四、美国Stratagene公司的实时荧光PCR仪(100)

五、Roche公司的LightCycler实时荧光PCR仪(101)

六、Corbert的RotorGene实时荧光PCR仪(103)

七、Eppendorf公司的Mastercyclereprealplex实时荧光PCR仪(104)

第三节实时荧光PCR仪选择(104)

一、仪器使用的广泛程度(104)

二、工作量(104)

三、耗材的开放性(105)

四、硬件设计特点(105)

五、检测通道和可检测的荧光染料(105)

六、温度梯度功能(105)

七、软件功能(105)

第四节数字PCR仪简介(106)

一、微流控芯片数字PCR(107)

二、液滴数字PCR(107)

第五节实时荧光PCR仪的使用、维护和校准(108)

一、实时荧光PCR仪使用中的注意事项(108)

二、维护和校准(108)

参考文献(111)

第7章临床PCR检验仪器设备的使用、维护和校准(112)

第一节天平(112)

一、电子分析天平及其分类(112)

二、天平的正确使用(113)

三、天平的选择(114)

四、天平的维护和校准(114)

第二节离心机(115)

一、离心机离心的基本原理(115)

二、离心力和相对离心力(116)

三、离心时间(116)

四、离心转子的选择(119)

五、离心管(119)

六、离心机的分类(119)

七、离心机的使用和维护(120)

第三节微量加样器(122)

一、微量加样器的一般原理及分类(122)

二、加样器的选择及使用(123)

三、加样器的维护和校准(129)

参考文献(133)

第8章临床PCR检验的质量保证(134)

第一节概述(134)

一、基本概念(134)

二、质量保证、室内质量控制和室间质量评价之间的关系(136)

三、标本采集、运送、保存及其质量控制(136)

第二节室内质量控制(137)

一、测定前质量控制(137)

二、核酸样本的制备、扩增检测及其质量控制(144)

三、统计学质量控制(146)

第三节室间质量评价(160)

一、室间质量评价的程序设计(161)

二、室间质量评价的局限性(164)

参考文献(165)

第9章病毒核酸检测的标准物质及其应用(167)

第一节概述(167)

一、基本概念(167)

二、病毒核酸检测用标准物质的种类和溯源关系(169)

第二节病毒核酸检测用标准物质的制备(170)

一、原材料的选择和分装(171)

二、均匀性和稳定性(172)

三、定值(174)

四、标准物质的保存(175)

五、核酸检测用标准物质的意义(175)

六、核酸检测用标准物质的展望(176)

参考文献(179)

第10章甲型肝炎病毒实时荧光PCR检测及临床意义(182)

一、HAV的特点(182)

二、HAVRNA实时荧光RTGPCR检测(182)

三、HAVRNA检测的临床意义(185)

参考文献(186)

第11章乙型肝炎病毒实时荧光PCR检测及临床意义(187)

一、HBV的特点(187)

二、HBVDNA实时荧光PCR测定(190)

三、HBV变异的检测及其临床意义(196)

四、HBVcccDNA的检测及其临床意义(200)

五、HBV基因型的检测及其临床意义(201)

六、HBVRNA的检测及其临床意义(204)

七、HBV全基因组测定及其临床意义(205)

参考文献(206)

第12章丙型肝炎病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(210)

一、HCV的形态和基因组结构特点(210)

二、HCV的复制特点(211)

三、HCV的变异特点及基因型(211)

四、HCVRNA实时荧光RTGPCR测定(212)

五、HCV基因分型检测及其临床意义(220)

参考文献(223)

第13章人免疫缺陷病毒G1实时荧光RTGPCR检测及临床意义(226)

一、HIVG1的特点(226)

二、HIVG1RNA的实时荧光RTGPCR测定(227)

三、HIVG1RNA测定的临床意义(234)

参考文献(235)

第14章人乳头瘤病毒实时荧光PCR检测及临床意义(237)

一、HPV的形态和基因结构特点(237)

二、HPV的体内复制特点(239)

三、病毒的变异特点(239)

四、HPV基因型(240)

五、HPVDNA的实时荧光PCR测定(240)

六、HPVDNA检测的临床意义(248)

参考文献(250)

第15章巨细胞病毒实时荧光PCR检测及临床意义(253)

一、人类巨细胞病毒的特点(253)

二、人类巨细胞病毒实时荧光PCR测定(254)

三、巨细胞病毒PCR检测的临床意义(267)

参考文献(268)

第16章严重急性呼吸综合征冠状病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(269)

一、SARSGCoV的特点(269)

二、SARSGCoVRNA实时荧光RTGPCR检测(270)

三、SARSGCoVPCR检测的临床意义(286)

参考文献(286)

第17章EB病毒实时荧光PCR检测及临床意义(288)

一、EB病毒的特点(288)

二、EB病毒实时荧光PCR测定(289)

三、EB病毒PCR检测的临床意义(294)

参考文献(295)

第18章流感病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(296)

一、流感病毒的特点(296)

二、流感病毒的实时荧光RTGPCR测定(298)

三、流感病毒RTGPCR检测的临床意义(320)

参考文献(320)

第19章风疹病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(321)

一、风疹病毒的形态和基因组结构及功能特点(321)

二、风疹病毒的复制特点(322)

三、风疹病毒的变异特点及基因型(323)

四、风疹病毒实时荧光RTGPCR测定及其临床意义(323)

参考文献(330)

第20章麻疹病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(332)

一、麻疹病毒的形态和基因组结构及功能特点(332)

二、麻疹病毒的复制特点(334)

三、麻疹病毒的变异特点及基因型(335)

四、麻疹病毒实时荧光RTGPCR测定及其临床意义(335)

参考文献(339)

第21章手足口病病原体实时荧光RTGPCR检测及临床意义(341)

一、手足口病病原体的形态和基因组结构特点(341)

二、shou足口病病原体复制特点(341)

三、手足口病病原体实时荧光RTGPCR测定及其临床意义(342)

四、手足口病病原体检测及其临床意义(349)

参考文献(349)

第22章埃博拉病毒实时荧光定量RTGPCR检测及临床意义(351)

一、EBOV的形态和基因组结构特点(351)

二、EBOV的基因分型(352)

三、EBOVRNA实时荧光RTGPCR测定及其临床意义(352)

参考文献(360)

第23章中东呼吸综合征冠状病毒实时荧光RTGPCR检测及临床意义(361)

一、MERSGCoV的形态和基因组结构特点(361)

二、MERSGCoV的感染过程(362)

三、MERSGCoVRNA实时荧光RTGPCR测定及其临床意义(363)

参考文献(379)

第24章沙眼衣原体实时荧光PCR检测及临床意义(381)

一、沙眼衣原体的形态和基因组结构特点(381)

二、沙眼衣原体的实时荧光PCR测定(381)

三、沙眼衣原体PCR检测的临床意义(391)

参考文献(391)

第25章结核杆菌实时荧光PCR检测及临床意义(394)

一、结核杆菌的特点(394)

二、结核杆菌实时荧光PCR检测(395)

三、结核杆菌PCR检测的临床意义(405)

参考文献(406)

第26章淋病奈瑟菌实时荧光PCR检测及临床意义(407)

一、淋病奈瑟菌的特点(407)

二、淋病奈瑟菌实时荧光PCR测定(408)

三、淋病奈瑟菌PCR检测的临床意义(418)

参考文献(419)

第27章幽门螺杆菌实时荧光PCR检测及临床意义(420)

一、幽门螺杆菌的特点(420)

二、幽门螺杆菌实时荧光PCR测定(421)

三、幽门螺杆菌PCR检测的临床意义(430)

参考文献(430)

第28章肺炎支原体实时荧光PCR检测及临床意义(432)

一、肺炎支原体的结构特点(432)

二、肺炎支原体的实时荧光PCR检测(432)

三、肺炎支原体PCR检测的临床意义(437)

参考文献(437)

第29章刚地弓形虫实时荧光PCR检测及临床意义(438)

一、刚地弓形虫的特点(438)

二、刚地弓形虫的实时荧光PCR检测(439)

三、刚地弓形虫PCR检测的临床意义(444)

参考文献(444)

第30章解脲支原体实时荧光PCR检测及临床意义(446)

一、解脲支原体的特点(446)

二、解脲支原体实时荧光PCR检测(446)

三、解脲支原体PCR检测的临床意义(451)

参考文献(452)

第31章EGFR基因实时荧光PCR检测及临床意义(453)

一、EGFR基因特点及常见突变类型(453)

二、相关靶向治疗药物(454)

三、EGFR基因突变实时荧光PCR测定及其临床意义(455)

参考文献(463)

第32章KRAS基因实时荧光PCR检测及临床意义(466)

一、KRAS基因特点及常见突变类型(466)

二、KRAS基因突变实时荧光PCR测定及其临床意义(466)

参考文献(477)

第33章BRAF基因突变的实时荧光PCR检测及临床意义(479)

一、BRAF的基因组结构特点(479)

二、BRAF基因突变实时荧光PCR测定及其临床意义(480)

参考文献(484)

第34章PIK3CA基因突变实时荧光PCR检测及临床意义(486)

一、PIK3CA的基因结构特点(486)

二、PIK3CA基因突变实时荧光PCR测定及其临床意义(487)

参考文献(497)

==参考文献==
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