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遗址发现于1973年夏，此后的两次发掘发现遗址包含4个叠压地层，揭露了干栏式建筑等遗迹 <ref>[http://www.naic.org.cn/html/2017/gjjy_0822/19192.html 河姆渡遗址 独特的干栏式建筑]，来源：古建中国 作者：佚名 责任编辑：贺兰静</ref> ，出土了夹炭[[黑陶]]等遗物和大量动植物遗存和栽培稻谷，一时轰动学术界，其代表的考古文化被命名为“河姆渡文化”。

1982年，河姆渡遗址被公布为全国重点文物保护单位，2001年被《考古》杂志评为“中国20世纪100项考古大发现”之一 <ref>[http://www.taiwan.cn/lshshj/whlshshj/wwbl/200209/t20020919_79780.htm 中国20世纪100项考古大发现]，中国台湾网， 时间:2002-09-19 14</ref> 。发现地建有河姆渡遗址博物馆和遗址展示区。