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区内地貌复杂，山势险峻，沟壑纵横，溪涧回绕。海拔 280~1434米。南高北低，中间贯穿着河流、瀑布与切割很深的高崖陡坡。植被茂密，动植物资源丰富，有高等植物2500余种，鸟兽类150余种，昆虫800余种，是南岭山地东部一个典型的亚热带森林生态系统地区 ，亚洲东部温带--亚热带植物区系的代表区域，也是东亚植物区系的发源地。有蕨类植物 250余种，脊椎动物150余种。

同时所处的南岭稀有稀土多金属成矿区，成矿地质条件优越，但区内的矿产斟查工作程度低。在保护区周边县乡分布有海内外著名的大吉山钨矿、归美山钨矿、龙志稀土矿等，还有夹湖与汤湖等地热资源。