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政變後的混亂導致馬利北境超過半數領土遭蓋達組織、激進及分離主義叛軍佔領，武裝衝突造成超過20萬以上難民逃往阿爾及利亞、茅利塔尼亞、布吉納法索和尼日等國。法國與部分非洲國家，應過 度 渡 政府要求出兵協助平叛、打擊恐怖組織，基本上政府軍控制北方地區。