===为求学术、甘坐冷板凳===
"弱水三千，只取一瓢饮"，1986 1986 年，年仅22岁的吴国盛硕士毕业了，当时的他面临着多种选择:出国、从政、做学术，等等。最终，他选择了学术作为他一生的志业，进入了中国社会科学院哲学研究所，从事科学史与科学哲学研究工作，开始了长达13年的社科院的科研与学习生涯。 在离开中国社科院已近10年，提起当年的那段岁月他依然十分留恋，他说:"对于一个有志于学术的年轻人来说，社科院无疑是一个最理想的选择了。因为在那里你不会受到太多的干扰，可以专注于自己的研究。我大部分的成果都是在社科院的时候做出来的。"
那个时候的吴国盛虽然年轻，却一心一意要做一个在学术方面有所造诣的学者。为求学术上的发展，他摒弃了外界所有的诱惑，在清贫的日子里坚守着科研的冷板凳。
"苦心人，天不负，卧薪尝胆，百二秦川终属楚。"功夫不负有心人， 经过许多个日夜的苦读、思考、探索、求证，1996年5月，他的名为《希腊人的空间概念》与《重建自然哲学》的两篇论文相继被中国自然辩证法研究会评为"自然辩证法青年成果奖"与"《自然辩证法研究》创刊10周年优秀论文奖"。他的著作《科学的历程》也在1996年、1997年先后被中宣部、中国社会科学院、共青团中央等权威部门评为"五个一工程"著作奖、第二届全国青年优秀社会科学成果奖、首届胡绳学术奖，并在1999年被科技部、中科院、全国科协评为"科学家推荐的20世纪百部科普佳作"，列入了新华书店总店《全国新书目》的"新中国50年百部名著"。
1997年，他的著作《自然的退隐》再获中宣部"五个一"工程奖。1998年，他主编的丛书《绿色经典文库》获吉林省新闻出版局的"年度吉林省长白山优秀图书奖"。1999年其著作《时间的观念》获中国社会科学院"第三届青年优秀科研成果奖(专著类二等)"。除此之外，1998年他还获中组部、人事部、中国科协联合颁发的"第六届中国青年科技奖"。