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自然保护区动物资源丰富，已鉴定命名的脊椎动物与昆虫有119科806种，国家重点保护野生动物32种，其中，一级重点保护动物1种，二级重点保护动物31种。国家一级重点保护野生动物豹，二级重点保护野生动物弥猴、穿山甲、大灵猫、小灵猫等。佛顶山自然保护区以森林山地景观为主体的旅游资源十分丰富，旅游景观类型多样，包括山地、河谷、森林植被、宗教文化、自然及人文景观类型，具有较高的旅游价值，是一处集科考探险与登高览胜的好去处，2006年被批准为省级自然保护区。