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東部區域因地質構造頗為複雜，地震常發生在斷層附近，發生頻率約佔台灣地區的52.7％，頻度大但少有破壞性強震發生。民國八十八年九月二十一日集集大地震後，內政部營建署依最新強地動資料於民國八十八年十二月修正台灣地區建築技術規則耐震設計，依震區水平加速度係數將全省劃分為地震甲區及地震乙區，花蓮地區因屬於地震甲區，故於本案若配置有結構體設施，設計時其對應之加速度係數應採用0.33g 。

就區域性之集水區而言，本基地係位於秀姑巒溪之流域範圍，基地南緣緊鄰發源於虎頭山的紅葉溪，東側有富源溪，西、北兩富源溪支流蜿蜒流過；規劃範圍內供農業生產使用之灌溉水圳呈現縱橫阡陌景象。