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立法會選舉方面，她在2004年加入民建聯（香港民主建港協進聯盟），並隨[[曾鈺成]]名單排名第三參選2004年立法會選舉九龍西地區直選，但由於比例代表制下未能晉身立法會。2008年，由於港島區的前民建聯主席[[馬力]]過世，黨內重量級人馬曾鈺成被派往港島區參選，於是李慧瓊便被看中被排在民建聯名單首位出戰2008年立法會選舉九龍西選區，最後憑著民建聯與工聯會的催穀下輕鬆勝出，更成為該區之選票量最高名單。值得著意的是，她在多次選舉中與不少議員一樣有同時以民建聯與工聯會的政黨聯繫參選。

2012年，李慧瓊獲香港特別行政區行政長官[[梁振英]]任命為香港行政會議非官守議員。