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'''中国科学院昆明分院'''前身是 [[ 中国科学院 ]] 成立于1957年的中国科学院昆明办事处，1958年扩建为中国科学院云南分院，1962年，中国科学院云南分院与四川分院、贵州分院合并，共同在成都成立中国科学院西南分院。1978年10月，经国务院批准，西南分院撤销，成立中国科学院昆明分院。

昆明分院作为中国科学院的派出机构，负责联络和协调中国科学院在 [[ 云南 ]] 和贵州地区的昆明植物研究所、昆明动物研究所、西双版纳热带植物园、地球化学研究所、云南天文台5个科研单位。截至2022年底，昆明分院系统共有在职职工1841人（包含所属单位人员），其中科技人员1375人，包括中国科学院院士8人，第三世界科学院院士2人， [[ 研究 员306 员]]306 人，副研究员417人。

昆明分院建有4个国家重点实验室，8个院重点实验室，15个地方重点实验室，9个工程中心，2个大科学设施：中国西南野生生物种质资源库、模式动物表型与遗传研究国家重大科技基础设施（灵长类设施）（建设中）；3个院级研究中心：中国科学院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心、中国科学院东南亚生物多样性研究中心、中国科学院中非联合研究中心；有探月工程地面应用系统40米射电望远镜、亚洲最大口径的2.4米通用光学望远镜、亚洲最大的地面太阳观测基地-抚仙湖一米太阳塔、西双版纳万种植物园、 [[ 昆明动物博物馆 ]] 、西南生物多样性实验室、国家昆明高等级生物安全灵长类实验中心/生物安全三级实验室、中科院生物安全大科学研究中心（昆明分部）、国家非人灵长类实验动物资源库、中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心，国家级（省级）野外台站等重大科研平台，拥有一批先进的大型科研仪器设备和完善的 [[ 计算机 ]] 网络系统及生物多样性信息系统。

昆明分院机关内设综合 [[ 办公室 ]] 、党办、组织人事处、科技与教育处、资产财务处、监督审计处六个部门，主要职能是负责院属5个研究单位党的建设；领导班子队伍建设；组织和促进中国科学院与云贵两省的联系和合作；协调中科院研究所与地方展开院地科技合作；做好综合协调工作，为研究所服务；协调国际科技合作的相关工作，搭建与 [[ 东南亚 ]] 国家的合作交流平台。