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此列車為1988年[[青函隧道]]通車後，取代停開的[[青函連絡船]]深夜航班所開行。列車名稱取自開花植物[[玫瑰]]，與[[北斗星號]]及[[海峽號]]等列車的名稱皆為1987年11月公開徵求命名活動而定名<ref>[https://www.jrhokkaido.co.jp/train/261/index.html 261系5000代 多目的特急車両 「はまなす」編成・「ラベンダー」編成 ]，JR北海道，2023-02-19查閱</ref>。
2012年3月17日，行駛於[[大阪車站]]至[[新潟車站]]間的 [[ 臥鋪急行({{{lang|ja|きたぐに|(列車)}})（]]{{lang|ja|きたぐに}}）停駛後，玫瑰號成為[[JR集團]]中碩果僅存的定期班次臥鋪急行列車；2015年8月22日，行駛於[[上野車站]]至札幌車站的[[北斗星號列車]]停駛後，此列車成為最後一列行經青函隧道及使用[[日本國鐵14系客車|14系]]、[[日本國鐵24系客車|24系]]車廂的定期班次夜車。
但因[[北海道新幹線]]會於2016年3月通車營運，新幹線與在來線共用[[海峽線]][[青函隧道]]，其[[架空電車線]]電壓將於新幹線開始營運時從現行20,000[[伏特]]50Hz交流電，升壓至25,000伏特。除了[[JR貨物]]新採購的[[JR貨物EH800型電力機車|EH800型電力機車]]與JR東日本[[四季島號列車|四季島號]]使用的[[JR東日本E001系電聯車|E001系電聯車]]以外，其他在來線的電力機車與電聯車都無法在升壓後駛入海峽線。2015年9月15日，JR東日本與JR北海道宣佈於2016年3月26日起，停駛玫瑰號、[[仙后座號列車|仙后座號]]及[[超級白鳥號列車|超級白鳥號/白鳥號]]等行駛海峽線的在來線客運列車。